如何在不使用外部包的情况下在 R 中制作漂亮的双标图？

Question

我非常喜欢典型的 R 情节。今天我要做一个biplot，但是典型的biplot很难看。有没有办法让它更漂亮，画椭圆等而不用其他包？

如果不可能，我怎样才能把它画成经典的 R 图？

DF <- iris
PCA <- prcomp(DF[,c(1:4)], scale. = T, center = T)
biplot(PCA)

结果：

一个想要的结果（在 PAST3 中制作）

Answer 1

我注意到您的 PAST3 版本中绘制的点似乎与 R 双标图中的点不匹配。看起来两个版本中的 y 轴都翻转了。

从 prcomp 返回的结构包含您制作更好风格所需的结构。投影点在 PCA$x 中，因此您可以使用

从基础 R 绘图中获得所需的绘图

plot(PCA$x[,1:2], pch=20, col=iris$Species)

为了添加省略号，我总是使用汽车包中的 dataEllipse，但这超出了您不使用其他包的要求。

更新

根据评论中的要求，我正在添加如何使用 car 包添加省略号。

library(car)
plot(PCA$x[,1:2], pch=20, col=iris$Species)
dataEllipse(PCA$x[,1], PCA$x[,2], iris$Species, lwd=1,
    group.labels = NULL, plot.points=FALSE, add=TRUE,
    fill=TRUE, fill.alpha=0.02)

我选择了一些我认为不错的东西，但是 dataEllipse 允许您进行多种调整。只需查看帮助页面，即可根据自己的喜好进行调整。

如何在不使用外部包的情况下在 R 中制作漂亮的双标图？

How to make a pretty biplot in R without using external packages?

r

plot

pca

biplot