在 Cython 中将结构自动转换为字典

Question

所以，如果您有一个 header 文件。

%%file test.h

struct mystruct{
  int i;
  int j;  
};

然后用 Cython 包装它：

cdef extern from "test.h" nogil:
  struct mystruct:
    int i
    int j

还有一些 returns 返回到 Py 的函数：

def spit_out_dict():
  return mystruct(5,10)

Cython 正确地自动生成了一个字典包装器。但是，当我将原始 C header 包装在命名空间中时，我无法让 Cython 仍然正确生成 dict 包装器，大致如下：

%%file test2.h

namespace outerspace{
struct mystruct{
  int i;
  int j;  
};
}

和Cython/Python：

cdef extern from "test2.h" namespace "outerspace" nogil:
  struct mynewstruct:
    int i
    int j

def spit_out_dict():
  return mynewstruct(5,10)

这不会编译 -- 很多命名空间投诉错误 -- 以前有人遇到过这种情况吗？

Answer 1

你的问题是 Cython 似乎只希望命名空间与 cppclass 一起使用。对于结构，它生成一些函数，但只是复制完整的命名空间名称，导致错误：

static PyObject* __pyx_convert__to_py_outerspace::mystruct(struct outerspace::mystruct s);
                  ^
py_bit.cpp: In function ‘PyObject* __pyx_pf_6py_bit_spit_out_dict(PyObject*)’:
py_bit.cpp:721:15: error: ‘__pyx_convert__to_py_outerspace’ has not been declared

它正在尝试创建一个名为 __pyx_convert__to_py_<classname> 的函数。（我认为这可能值得提交错误报告。）

在这种情况下的技巧通常是对 Cython 撒谎。我创建了三个文件：

// test2.hpp
namespace outerspace{
struct mystruct{
  int i;
  int j;  
};
}

,

// test2_cy.hpp - a wrapper file purely for Cython's benefit
#include "test2.hpp"

using outerpsace::mystruct;

和 cython 文件

cdef extern from "test2_cy.hpp": # (I didn't test with "nogil", but it's probably fine...)
  struct mynewstruct:
    int i
    int j

def spit_out_dict():
  # for some reason using "return mystruct(5,10)" doesn't work, but this does...
  cdef mystruct a = mystruct(5,10)
  return a

Answer 2

这是 Cython 中的一个错误，已在 https://github.com/cython/cython/commit/fa946e8435a4dcc3497fc7b0f4e87256d40844ba

修复

在 Cython 中将结构自动转换为字典

Auto Conversion of Structs to Dicts in Cython

cython