防止重复安装包，或在 R 中预安装包

Question

我有一个使用 rpy2 从 python 调用的 R 脚本。它使用 dplyr、doBy 和 ggplot2。该脚本具有针对这 3 个包的 install.packages 命令。即使已经安装了软件包，它仍然会下载、构建和安装它们，这非常耗时。有没有办法让它只在软件包尚未安装的情况下进行安装？

此外，我运行在 docker 容器中，因此在实例化容器后，第一次脚本运行s 时包不存在。有没有办法预加载包，在这种情况下我不需要这些包的 install.packages 命令，我的上述问题将变得没有实际意义。

Answer 1

install.packages( setdiff(required_packages, installed.packages()[,"Package"]) )

如果您将required_packages定义为您需要的软件包名称的字符向量，则该行将只安装您当前没有的软件包。

所以对于你的情况：

required_packages <- c("dplyr", "doBy", "ggplot2")
install.packages( setdiff(required_packages, installed.packages()[,"Package"]) )

Answer 2

我总是使用：

if (!require(package)) install.packages("package")

因此，如果该包在库中不可用，则会安装它。

Preventing repeated package installation, or pre installing packages in R