使用文件名中的日期文本作为新列读取多个 csv 数据集

Question

我有多个要导入 R 的 csv 文件。

如何将多个文件读入 R 并在第一列的文件名中添加包含日期文本的列？

这里需要：

对于每个 csv 文件，在文件名中找到日期并将其添加为每个数据框的第一列，然后再绑定它们。

这是文件名中没有日期列的代码：

all <- lapply(c("file_10-16-2017.csv",
                "file_10-17-2017.csv",
                "file_10-18-2017.csv",
               function(x){
               read_csv(x, skip = 10)}) %>% bind_rows()

我希望我的最终结果看起来像这样：

Date_Pulled      Week         Date      spot1      Site ID test 
 10-16-2017  10/15/17   10/16/2017      trial          trial134
     .           .           .             .              .
     .           .           .             .              .
     .           .           .             .              .
 10-17-2017  10/15/17   10/16/2017      trial          trial134
     .           .           .             .              .
     .           .           .             .              .
     .           .           .             .              .

任何帮助都会很棒，谢谢！

Answer 1

首先，将所有要读取的文件放到一个单独的工作目录中，然后将工作目录更改为这个目录。

# 1. change wd
setwd('new_file_path')

# 2. get files from that directory
my_files <- list.files()

# 3. read in all files, skipping first 10 lines
library(readr)
dat_list <- lapply(my_files, read_csv, skip = 10)

# 4. mutate a new column, which is the name of the file
library(dplyr)
dat_list_new <- lapply(dat_list, function(x) {
    mutate(x,
           new_col_one = names(x))
})

# 5. port this list of data frames to the global environment
names(dat_list_new) <- my_files # set the names of the dataframes
list2env(dat_list_new,envir=.GlobalEnv)

Answer 2

我想出了另一种方法：

filenames <- list.files(path = ".", pattern = NULL, all.files = FALSE, full.names = FALSE, recursive = FALSE, ignore.case = FALSE)

read_csv_filename <- function(filenames){
  ret <- read.csv(filenames, skip = 10)
  ret$Source <- filenames #EDIT
  ret
}

import.list <- ldply(filenames, read_csv_filename)

这应该可以解决问题

使用文件名中的日期文本作为新列读取多个 csv 数据集

Read multiple csv datasets with the date text from file name as new column

csv

r

readr