批量添加图到散景

Question

我想根据每条线的两个点将 10,000 条线添加到 bokeh 图中。一个一个地添加它们非常慢，最多可能需要一个小时。有什么办法可以加快速度吗？

import pandas as pd
import numpy as np
from bokeh.plotting import figure, show, output_file
output_file('temp.html')

p = figure(plot_width=500, plot_height=400)
df = pd.DataFrame(np.random.randint(0,100,size=(10000, 4)), columns=['x1', 'x2', 'y1', 'y2'])
print df
for index, row in df.iterrows():
    p.line([row['x1'], row['x2']], [row['y1'], row['y2']], line_width=2)

show(p)

编辑：

多行

import pandas as pd
from bokeh.models.glyphs import MultiLine
from bokeh.models import ColumnDataSource
import numpy as np
from bokeh.plotting import figure, show, output_file

output_file('temp.html')

p = figure(plot_width=500, plot_height=400,
           )
df = pd.DataFrame(np.random.randint(0, 100, size=(10000, 4)), columns=['x1', 'x2', 'y1', 'y2'])
source = ColumnDataSource(dict(
    xs=df[['x1', 'x2']].as_matrix(),
    ys=df[['y1', 'y2']].as_matrix(),
)
)

glyph = MultiLine(xs="xs", ys="ys", line_color="#8073ac", line_width=2)
p.add_glyph(source, glyph)
show(p)

Answer 1

编辑：对于这种具有单段线的特定应用，最好的解决方案是使用矢量化 segment 字形方法。

对于这种用法，Bokeh 不是正确的工具，至少它本身不是。为了支持各种交互功能，Bokeh 针对更少的字形进行了显式优化，每个字形具有更多数据。每个新字形都会产生固定的开销，而 10000 个字形对于 Bokeh 本身来说永远是不合理的。一种选择可能是使用所有行的所有数据对 multi_line 进行一次调用，而不是对 line 进行数千次不同的调用。但是，您可能还想看看 Datashader，它对于可视化更大的数据集（多达数十亿个点）很有用，它与 Bokeh 无缝集成以提供此类数据集的交互性。

批量添加图到散景

Bulk adding plots to Bokeh

python

python-2.7

bokeh