提取存储在 SQL 列中的由“:”分隔的字符串的第 n 个字段

Question

我有一个 SQL table 包含以下列：

FORMAT  Sample
GT:AD:DP:GQ:PL  0/0:233,0:233:99:0,120,1800
GT:AD:DP:GQ:PL  0/1:101,61:220:99:835,0,1859
GT:AD:DP:GQ:PL  0/0:172,0:172:99:0,120,1800
GT:AD:DP:GQ:PL  0/0:216,0:216:99:0,120,1800
GT:AD:DP:GQ:PL  0/0:216,0:216:99:0,120,1800
GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL  0/1:185,232:417:99:0|1:8029494_T_G:8670,0,6429
GT:AD:DP:GQ:PL  0/0:367,0:367:99:0,120,1800
GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL  0/1:150,198:348:99:0|1:8029494_T_G:7930,0,5677
GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL  0/1:148,196:344:99:0|1:8029494_T_G:7876,0,5652
GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL  0/0:148,0:344:99:0|1:8029494_T_G:7876,8334,14591
GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL  0/0:148,0:344:99:0|1:8029494_T_G:7876,8334,14591

FORMAT 列指定以下列分隔的字段的 ID，以“：”分隔。

我想根据 FORMAT 列中的 ID/position 从第二列中提取特定字段，即 AD（第二）、DP（第三）或 GQ（第四）。

我能够使用以下代码提取 AD 字段：

SELECT SUBSTRING(Sample, CHARINDEX(':',Sample)+1, CHARINDEX(':',Sample,5)-5) FROM Table 1;

问题是我无法提取字段 DP 或 GQ，因为不同字段的长度并不总是相同的，我无法指定哪个应该是搜索以下内容的起始位置“ :" 位置。

我也试过使用这个网站的拆分功能：

http://www.sqlteam.com/forums/topic.asp?TOPIC_ID=50648

问题是我不知道如何将列声明为变量，以便我可以为 table.

的每一行提取所需的字段

[示例] 列的所需输出应如下所示：

GT  AD  DP  GQ
0/0 233,0   233 99
0/1 101,61  220 99
0/0 172,0   172 99
0/0 216,0   216 99
0/0 216,0   216 99
0/1 185,232 417 99
0/0 367,0   367 99
0/1 150,198 348 99
0/1 148,196 344 99
0/0 148,0   344 99
0/0 148,0   344 99

如有任何帮助，我们将不胜感激，

谢谢，

Answer 1

可能有点XML作为解析器

例子

Select A.Format
      ,B.*
 From  YourTable A
 Cross Apply (
                Select Pos2 = ltrim(rtrim(xDim.value('/x[2]','varchar(max)')))
                      ,Pos3 = ltrim(rtrim(xDim.value('/x[3]','varchar(max)')))
                      ,Pos4 = ltrim(rtrim(xDim.value('/x[4]','varchar(max)')))
                From  (Select Cast('<x>' + replace((Select replace(A.Format,':','§§Split§§') as [*] For XML Path('')),'§§Split§§','</x><x>')+'</x>' as xml) as xDim) as A 
             ) B

Returns

Format                  Pos2    Pos3    Pos4
GT:AD:DP:GQ:PL          AD      DP      GQ
GT:AD:DP:GQ:PL          AD      DP      GQ
GT:AD:DP:GQ:PL          AD      DP      GQ
GT:AD:DP:GQ:PL          AD      DP      GQ
GT:AD:DP:GQ:PL          AD      DP      GQ
GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL  AD      DP      GQ
GT:AD:DP:GQ:PL          AD      DP      GQ
GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL  AD      DP      GQ
GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL  AD      DP      GQ
GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL  AD      DP      GQ
GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL  AD      DP      GQ

或简单版本

Select A.Format
      ,Pos2 = Cast('<x>' + replace(Format,':','</x><x>')+'</x>' as xml).value('/x[2]','varchar(max)')
      ,Pos3 = Cast('<x>' + replace(Format,':','</x><x>')+'</x>' as xml).value('/x[3]','varchar(max)')
      ,Pos4 = Cast('<x>' + replace(Format,':','</x><x>')+'</x>' as xml).value('/x[4]','varchar(max)')
 From  YourTable A

或者如果打开一个 UDF

看看TSQL/SQL Server - table function to parse/split delimited string to multiple/separate columns

EDIT - Update for Sample

Select A.Format
      ,GT = Cast('<x>' + replace(Sample,':','</x><x>')+'</x>' as xml).value('/x[1]','varchar(max)')
      ,AD = Cast('<x>' + replace(Sample,':','</x><x>')+'</x>' as xml).value('/x[2]','varchar(max)')
      ,DP = Cast('<x>' + replace(Sample,':','</x><x>')+'</x>' as xml).value('/x[3]','varchar(max)')
      ,GQ = Cast('<x>' + replace(Sample,':','</x><x>')+'</x>' as xml).value('/x[4]','varchar(max)')
 From  YourTable A

提取存储在 SQL 列中的由“:”分隔的字符串的第 n 个字段

Extracting nth field of string delimited by ":" stored in a SQL column

sql-server

string

split

substring

charindex