使用 tidygraph 生成的列表列重塑数据框

Question

我正在使用 tidygraph 包并尝试找到 "tidy" 解决方案对于下面的例子。这个问题并没有真正与 tidygraph 相关，更多的是关于数据争论，但我认为使用这个包的人很有趣。

在下面的代码块中，我只是生成了一些样本数据。

library(tidyverse)
library(tidygraph)
library(igraph)
library(randomNames)
library(reshape2)

graph <- play_smallworld(1, 100, 3, 0.05) 

labeled_graph <- graph %>% 
                    activate(nodes) %>%
                    mutate(group = sample(letters[1:3], size = 100, replace = TRUE),
                           name = randomNames(100)
                           )

sub_graphs_df <- labeled_graph %>% 
                    morph(to_split, group) %>%
                    crystallise()

结果 data.frame 如下所示：

sub_graphs_df
# A tibble: 3 x 2
      name           graph
     <chr>          <list>
1 group: a <S3: tbl_graph>
2 group: b <S3: tbl_graph>
3 group: c <S3: tbl_graph>

现在谈谈我的实际问题。我想对列 graph 中的每个元素应用一个函数。结果只是一个命名向量。

sub_graphs_df$graph %>% map(degree)

我不喜欢的第一件事是 $ 的子集化。有没有更好的方法？

接下来，我想将此结果重塑为只有一个 data.frame 的 3 列。一列用于 name（向量的名称属性），一列用于 group（列表的名称属性），一列用于 number（向量的元素）。

我尝试了 reshape2 包中的 melt。

sub_graphs_df$graph %>% map(degree) %>% melt

它工作得很好，但名字丢失了，当我读到它时，应该使用 tidyr 代替。但是，我无法让 gather 工作，因为只接受 data.frames。

另一种选择是 unlist：

sub_graphs_df$graph %>% map(degree) %>% unlist

此处组和名称位于名称属性中，我必须使用正则表达式来恢复它们。

我很确定有一种我想不到的简单方法。

Answer 1

我们可以使用 mutate 创建一个 list 列，同时应用 map 的函数，提取 names 和整数以及 unnest 来创建'long' 格式化数据集

sub_graphs_df %>%
   mutate(newout = map(graph, degree)) %>%
   transmute(name, group = map(newout, ~.x %>% names), number = map(newout, as.integer)) %>%
    unnest
# A tibble: 100 x 3
#   name     group              number
#   <chr>    <chr>               <int>
# 1 group: a Seng, Trevor            0
# 2 group: a Buccieri, Joshua        1
# 3 group: a Street, Aimee           2
# 4 group: a Gonzalez, Corey         2
# 5 group: a Barber, Monique         1
# 6 group: a Doan, Christina         1
# 7 group: a Ninomiya, Janna         1
# 8 group: a Bazemore, Chao          1
# 9 group: a Perfecto, Jennifer      1
#10 group: a Lopez Jr, Vinette       0
# ... with 90 more rows

使用 tidygraph 生成的列表列重塑数据框

Reshaping a data frame with a list column produced by tidygraph

r

dplyr

tidyr

purrr

tidygraph