如何在 Google Colaboratory 上安装 libspatialindex

How to install libspatialindex on Google Colaboratory

为了使用 Python 高效地分析空间数据,我使用了 rtree 空间索引库,依赖于 libspatialindex C 库。

我能够使用 !pip install rtree.

在 Google Colaboratory notebook 中成功安装 rtree

正如预期的那样,这还不够,因为需要先安装 libspatialindex,正如 import rtree 确认的那样:

OSError: Could not find libspatialindex_c library file

我不确定是否以及如何在 Google Collaboratory 中安装外部库。在 https://github.com/libspatialindex/libspatialindex/wiki/1.-Getting-Started 之后,我设法 运行 !curl -L http://download.osgeo.org/libspatialindex/spatialindex-src-1.8.5.tar.gz | tar xz 但我没有配置权限: !spatialindex-src-1.8.5/configure

/bin/sh: 1: spatialindex-src-1.8.5/configure: Permission denied

编辑:看起来错误已修复。构建不再需要下面的 !mount ... 命令。我已经相应地更新了 the example notebook

原回复如下。

这看起来像是 Colab 错误。 /content 目录挂载了 noexec,这是导致权限错误的原因。

在修复之前,您可以使用以下命令以 exec 权限重新安装 /content

!mount -o remount,exec /content

这是安装 libspatialindexrtree 的完整笔记本。 https://colab.research.google.com/notebook#fileId=1N7i9zmOwVcUzd4eHWZux4p_WTBMZHi8C