S4 类 - 使用可变数量的参数重载方法

Question

我想在我的 S4 泛型 myMethod 中有可变数量的参数，这样它们都是有效的：

myMethod(100)
myMethod(100, 200)

这是我尝试定义的：

setGeneric(
    "myMethod", 
    function(x) {

        standardGeneric("myMethod")
    })

setMethod(
    "myMethod", 
    signature = c("numeric"), 
    definition = function(x) {

        print("MyMethod on numeric")
    })

setMethod(
    "myMethod", 
    signature = c("numeric", "numeric"), 
    definition = function(x, y) {

        print("MyMethod on numeric, numeric")
    })

然而，这给出了错误：

Error in matchSignature(signature, fdef) : more elements in the method signature (2) than in the generic signature (1) for function ‘myMethod’

Answer 1

您的泛型应该支持 2 个参数。

setGeneric(
  "myMethod", 
  function(x, y) {
    standardGeneric("myMethod")
  })

此外，您的第二个方法中的函数实际上应该支持两个参数：

setMethod(
  "myMethod", 
  signature = c("numeric", "numeric"), 
  definition = function(x, y) {
    print("MyMethod on numeric, numeric")
  })

更一般地说，如果您想指定任意多个参数，您应该查看省略号参数 ...。

Answer 2

值得澄清的是您是否要 dispatch（select 一种方法）超过一个参数（在这种情况下，包括 [=13 中的所有参数名称） =] setGeneric())

setGeneric("fun", function(x, y) standardGeneric("fun"),
           signature=c("x", "y"))

setMethod("fun", c(x="numeric", y="numeric"), function(x, y) {
    "fun,numeric,numeric-method"
})

与基于第一个的分派（仅包括 signature= 中的第一个参数）和要求所有方法都有额外的参数（在通用函数中命名参数）

setGeneric("fun", function(x, y) standardGeneric("fun"),
           signature="x")

setMethod("fun", c(x="numeric"), function(x, y) {
    "fun,numeric-method"
})

或仅部分方法（在泛型中使用...，并在方法中命名参数）。

setGeneric("fun", function(x, ...) standardGeneric("fun"),
           signature="x")

setMethod("fun", c(x="numeric"), function(x, y) {
    "fun,numeric-method"
})

S4 类 - 使用可变数量的参数重载方法

S4 classes - overload a method with a variable number of arguments

r

generics

overloading

s4

arity