大都会黑斯廷斯 MCMC 与 R

Question

我正在尝试使用 MH 算法和 R 实现一个简单的 MCMC 问题是我得到了这个错误（我试图计算 alpha 但它不是 NA 问题）

Error in if (runif(1) <= alpha) { : missing value where TRUE/FALSE needed

这是我的函数，有人能发现问题吗？

    PoissonMetropolisHastingRW = function(n=100000,lambda=10,p=0.5,x0=0){

  x=rep(0,n); y=0; alpha = 0

  x[1]=x0
  for(i in 2:n){

    if (x[i-1] == 0){
      y = sample(c(0,1),1, prob=c(0.5,0.5))
      alpha = min(1,((lambda^y)*x[i-1]*p)/((lambda^x[i-1])*y*(1-p)))
      #alpha = min(1, ( ((lambda^y)*x[i-1])/( (lambda^x[i-1])*y) )*(p/(1-p)) ))
      if(runif(1)<=alpha) {x[i]=y}
      else {x[i]= x[i-1]}

    }
    if (x[i-1] > 0){
      y = sample(c(x[i-1]-1,x[i-1]+1), 1, prob=c(1-p,p))
      alpha = min(1,((lambda^y)*x[i-1]*p)/((lambda^x[i-1])*y*(1-p)))
      #alpha = min(1, (((lambda^y)*x[i-1]/((lambda^x[i-1])*y))*(p/(1-p))))
      if(runif(1) <= alpha) {x[i]=y}
      else {x[i]= x[i-1]}
    }
  } 
  return(x)



}

Answer 1

如果 y 恰好为 0（并且每次迭代的概率为 0.5，这肯定会发生），则 alpha 为 0 / 0（因为 x[i-1] == 0）。它给你 NaN。条件 something <= NaN 提供 NA.

大都会黑斯廷斯 MCMC 与 R

Metropolis-Hastings MCMC with R

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