plotly.offline.iplot 在 Jupyter 中给出一个大的空白字段作为输出 Notebook/Lab

Question

我正在尝试在 Jupyter notebook 中创建一个 Sankey 图表，我的代码基于 the first example shown here。

我最终得到了这个，我可以运行而不会出现任何错误：

import numpy as npy
import pandas as pd
import plotly as ply

ply.offline.init_notebook_mode(connected=True)

df = pd.read_csv('C:\Users\a245401\Desktop\Test.csv',sep=';')

print(df.head())
print(ply.__version__)

data_trace = dict(
    type='sankey',
    domain = dict(
      x =  [0,1],
      y =  [0,1]
    ),
    orientation = "h",
    valueformat = ".0f",
    node = dict(
      pad = 10,
      thickness = 30,
      line = dict(
        color = "black",
        width = 0.5
      ),
      label =  df['Node, Label'].dropna(axis=0, how='any'),
      color = df['Color']
    ),
    link = dict(
      source = df['Source'].dropna(axis=0, how='any'),
      target = df['Target'].dropna(axis=0, how='any'),
      value = df['Value'].dropna(axis=0, how='any'),
  )
)
print(data_trace)

layout =  dict(
    title = "Test",
    height = 772,
    width = 950,
    font = dict(
      size = 10
    ),    
)
print(layout)

fig = dict(data=[data_trace], layout=layout)
ply.offline.iplot(fig, filename='Test')

csv 文件如下所示：

Source;Target;Value;Color;Node, Label
0;2;2958.5;#262C46;Test 1
0;2;236.7;#262C46;Test 2
0;2;1033.4;#262C46;Test 3
0;2;58.8;#262C46;Test 4
0;2;5.2;#262C46;Test 5
0;2;9.4;#262C46;Test 6
0;2;3.4;#262C46;Test 7

看起来运行很好，各种输出 乍一看 是对的，但是 ply.offline.iplot(fig, filename='Test') 的最终输出只是显示了一个大的空白字段：在笔记本中的所有单元格一次运行之后，终端看起来像这样：

谁能指出我哪里出错了？

编辑：我还在 plotly 论坛上发布了这个问题：https://community.plot.ly/t/no-output-from-plotly-offline-iplot/8086 -

Answer 1

我过去在 Jupyter 中遇到过类似的离线绘图问题 - 有时它出人意料地不一致 when/why 绘图无法显示。从提高数据速率限制开始可能值得一试。

jupyter notebook --NotebookApp.iopub_data_rate_limit=1.0e10

Answer 2

对我来说，帮助将笔记本更改为 Trusted（这启用了 Javascript 并提供了将图形构建到 jupyter 笔记本中的巧妙方法。）。

您可以在此处找到此选项：

Answer 3

来自quickstart in the README

这显示了一个数字，而这里的 none 其他答案对我有用：

import plotly.graph_objs as go
fig = go.FigureWidget()
# Display an empty figure
fig

这（在新单元格中）用条形图和折线图修改了上面的图：

# Add a scatter chart
fig.add_scatter(y=[2, 1, 4, 3])
# Add a bar chart
fig.add_bar(y=[1, 4, 3, 2])
# Add a title
fig.layout.title = 'Hello FigureWidget'

如果这不起作用，请确保您的安装正确，例如pip install --user --upgrade plotly 如果你用 pip 安装

Answer 4

如果这些答案中的 none 对您有用。试试这个

只需在以管理员权限打开的 conda 提示符中执行此操作

pip install pip --upgrade
conda upgrade notebook or pip install notebook --upgrade

conda install -c conda-forge ipywidgets or pip install ipywidgets

您需要 jupyter notebook 和 ipywidgets 的最新版本。

Answer 5

我可以使用 jupyter notebook 服务器获得正确的显示（没有任何附加选项），但是得到一个空白块使用 jupyter lab 服务器 。相关版本信息：

$ jupyter lab --version
0.35.5
$ jupyter notebook --version
5.7.8
$ python -c "import plotly; print(plotly.__version__)"
3.10.0

因此，对于那些使用 JupyterLab 的人来说，要在 中正确显示离线 plotly 图表JupyterLab，我们需要使用以下命令安装plotly-extension（以下摘自）：

$ jupyter labextension install @jupyterlab/plotly-extension
$ jupyter labextension list 
$ jupyter lab build

Answer 6

使用 Google Colab 时，包含代码段 -

import plotly.io as pio
pio.renderers.default = 'colab'

或将整体导入语句用作 -

import plotly.offline as py
py.init_notebook_mode(connected=True)
import plotly.graph_objs as go
import plotly.io as pio
pio.renderers.default = 'colab'
from plotly.offline import init_notebook_mode, iplot

这会将渲染设置为 Colab 样式并显示绘图。

希望对您有所帮助。

Answer 7

我尝试了此处建议的所有解决方案，但 none 对我有用。解决问题的方法是添加：

import plotly.io as pio
pio.renderers.default='notebook'

并且还使用 fig.show("notebook") 而不是简单地 fig.show()，如 here 所建议的那样。

Answer 8

我自己也遇到过类似的问题，有旭日图。空白图是由于无效数据。我本以为会在运行时出错，但在极少数情况下似乎没有出现错误，而是显示空白图。

因此，请检查您的数据有效性，或使用 plotly doc 上提供的虚拟数据进行测试，以测试问题是否来自数据或 plotly/notebook 界面。

Answer 9

上面的一些方法对我有用。但是我按照这个discussion and the official troubleshooting guide.

很不灵巧地解决了这类问题

第一步：关闭你的 jupyter 实验室。然后，卸载 plotly 和一些扩展。

$ conda remove plotly
$ jupyter labextension uninstall jupyterlab-plotly
$ jupyter labextension uninstall plotlywidget

第 2 步：在与启动 JupyterLab 相同的环境中打开终端以重建 jupyter lab。

$ jupyter lab build

第 3 步：使用相同版本

$ conda install plotly
$ jupyter labextension install jupyterlab-plotly
$ jupyter labextension install plotlywidget

以上程序在 jupyter lab 中对我来说工作正常。我认为我们可以在 jupyter notebook.

中尝试相同的程序

Answer 10

在我这边，罪魁祸首是我在 firefox 上使用的“Darker Jupyter”插件。

Answer 11

包括这些行：

from plotly.offline import plot, iplot, init_notebook_mode
import plotly.graph_objs as go
init_notebook_mode(connected=True)

适合我

Answer 12

我的回复可能有点晚了，但与 Plotly 一起导入也很重要 plotly.graph。

这些是您需要导入的包。我也得到了空白输出，这对我有用。

from plotly.offline import plot, iplot, init_notebook_mode
import plotly.graph_objs as go
init_notebook_mode(connected=True)

Answer 13

我在尝试在 colab 中绘制热图时遇到了几乎类似的问题，对我来说，以下解决方案有所帮助：

import plotly.graph_objs as go
from plotly.offline import iplot
import chart_studio.plotly as py

# these two lines are what allow your code to show up in a notebook
import plotly.io as pio
pio.renderers.default='colab'

corr = data.corr()

trace = go.Heatmap(z=corr.values,
                  x=corr.index.values,
                  y=corr.columns.values)
data=[trace]
iplot(data, filename='basic-heatmap')

plotly.offline.iplot 在 Jupyter 中给出一个大的空白字段作为输出 Notebook/Lab

plotly.offline.iplot gives a large blank field as its output in Jupyter Notebook/Lab

python

plotly

jupyter

jupyter-notebook

jupyter-lab