在 R 中，素食主义者的 CCA 是否存在 "goodness of fit" 值，类似于 NMDS 的 "stress" 值？
in R, does a "goodness of fit" value exist for vegan's CCA, similar to NMDS's "stress" value?
我想知道是否有办法从素食 cca 对象中提取类似于 metaMDS "stress" 值的东西？我试过 goodness.cca 函数及其相关函数
(http://cc.oulu.fi/~jarioksa/softhelp/vegan/html/goodness.cca.html)
他们告诉我每个样本的统计数据，但我对将多维系统减少到二维的整体拟合优度感兴趣（如果存在类似的东西，因为它使用不同的计算）。
如果可能的话，我想继续吃纯素，尽管我在这里找到了这个 link：
(Goodness of fit in CCA in R)
非常感谢
RJ
称为特征值。早些时候有人抱怨说 NMDS 没有特征值之类的东西，只有压力。数据中的总变异是所有特征值的总和，因此特征值的比例或总特征值的累积和是按比例解释的。所有这些都可以用 eigenvals() 及其 summary() 提取（请参阅他们对 ?eigenvals 的帮助）。轴的显着性测试可通过其 anova.cca() 函数获得（查看其文档以获取参考）。
您提到的网页是关于另一种方法的，典型相关。在 vegan 中，我们在 CCorA 中使用排列测试。只需选择您的方法，然后找到您的工具。
我想知道是否有办法从素食 cca 对象中提取类似于 metaMDS "stress" 值的东西？我试过 goodness.cca 函数及其相关函数
(http://cc.oulu.fi/~jarioksa/softhelp/vegan/html/goodness.cca.html)
他们告诉我每个样本的统计数据，但我对将多维系统减少到二维的整体拟合优度感兴趣（如果存在类似的东西，因为它使用不同的计算）。 如果可能的话，我想继续吃纯素，尽管我在这里找到了这个 link：
(Goodness of fit in CCA in R)
非常感谢
RJ
称为特征值。早些时候有人抱怨说 NMDS 没有特征值之类的东西，只有压力。数据中的总变异是所有特征值的总和，因此特征值的比例或总特征值的累积和是按比例解释的。所有这些都可以用 eigenvals() 及其 summary() 提取（请参阅他们对 ?eigenvals 的帮助）。轴的显着性测试可通过其 anova.cca() 函数获得（查看其文档以获取参考）。
您提到的网页是关于另一种方法的，典型相关。在 vegan 中，我们在 CCorA 中使用排列测试。只需选择您的方法，然后找到您的工具。