Jenetics 库默认的初始种群和适应度计算

Question

我正在使用 Jenetics 以获得最大化问题的最佳人选。人口规模如何影响个人？

想象一下，我将从文件中读取的初始种群放入列表中

while( (line = bf.readLine())!=null){
String[] tokens = line.split(",");
chromossomes.add(IntegerChromosome.of(
  IntegerGene.of(Integer.parseInt(tokens[0]),0,100),                                            
  IntegerGene.of(Integer.parseInt(tokens[1]),0,100),                                                  
  IntegerGene.of(Integer.parseInt(tokens[2]),0,100)); 
}

如果文件包含 10 条染色体，然后我将人口设置为 100，那么剩下的 90 个人是随机创建的吗？

我也想知道这个适应度函数是否正确

private static int eval(Genotype<IntegerGene> gt) {
   int best=0,fitness=0;
   for(int i=0;i<gt.length();i++) {
       fitness = getFitness(gt.getChromosome(i));
       if (fitness > best){
           best = fitness;
       }
   }
 return best;
}

Answer 1

第一个问题的答案是肯定的。种群中缺失的个体是随机产生的。但更重要的是，您在从文件创建初始种群时犯了一个错误。我想你会喜欢做如下的事情。

final String[] lines = ...;
final ISeq<Genotype<IntegerGene>> population = Arrays.stream(lines)
    .mapToInt(Integer::parseInt)
    .mapToObj(i -> IntegerChromosome.of(IntegerGene.of(i, 0, 100)))
    .map(ch -> Genotype.of(ch))
    .collect(ISeq.toISeq());

这将每行创建一个个体 (Genotype)。

你截取的第二个代码看起来像是在尝试从一个个体的染色体中计算最佳值。我认为您将 Genotype（一个人）与人口（基因型列表）混淆了。适应度函数总是计算一个个体（Genotype）的适应度。

Jenetics 库默认的初始种群和适应度计算

Jenetics library default initial population and fitness calculation

java

genetic-algorithm

jenetics