文档之间的成对距离
Pairwise Distance between documents
我正在尝试计算一个文档术语矩阵的行与另一个文档术语矩阵的行的相似度。
A <- data.frame(name = c(
"X-ray right leg arteries",
"x-ray left shoulder",
"x-ray leg arteries",
"x-ray leg with 20km distance"
), stringsAsFactors = F)
B <- data.frame(name = c(
"X-ray left leg arteries",
"X-ray leg",
"xray right leg",
"X-ray right leg arteries"
), stringsAsFactors = F)
corp1 <- corpus(A, text_field = "name")
corp2 <- corpus(B, text_field = "name")
docnames(corp1) <- paste("A", seq_len(ndoc(corp1)), sep = ".")
docnames(corp2) <- paste("B", seq_len(ndoc(corp2)), sep = ".")
dtm3 <- rbind(dfm(corp1, ngrams=2), dfm(corp2, ngrams=2))
d1 = textstat_simil(dtm3, method = "cosine")
d1 = as.matrix(d1)
d1 = d1[grepl("^A.",row.names(d1)),grepl("^B.",colnames(d1))]
在代码中,我正在计算组合矩阵的相似度,然后从矩阵中删除不相关的单元格。是否可以在 textstat_simil(dtm3, method = "cosine")
中一次比较来自 A 的一份文档? table 下面是我要找的。当我使用 as.matrix(d1)
.
时,矩阵的文件大小也增加了一倍
B.1 B.2 B.3 B.4
A.1 0.3333333 0.0000000 0.4082483 1.0000000
A.2 0.4082483 0.0000000 0.0000000 0.0000000
A.3 0.4082483 0.7071068 0.0000000 0.4082483
A.4 0.0000000 0.5000000 0.0000000 0.0000000
这会起作用,尽管正如您所指出的,它将 dist
class return 从 textstat_simil()
强制转换为 matrix
.
d2 <- textstat_simil(dtm3, method = "cosine", diag = TRUE)
as.matrix(d2)[docnames(corp1), docnames(corp2)]
# B.1 B.2 B.3 B.4
# A.1 0.3333333 0.0000000 0.4082483 1.0000000
# A.2 0.4082483 0.0000000 0.0000000 0.0000000
# A.3 0.4082483 0.7071068 0.0000000 0.4082483
# A.4 0.0000000 0.5000000 0.0000000 0.0000000
请注意,您在创建 dtm3
时使用 ngrams=2
将根据 仅 双字母特征(很少见)创建 dfm。如果您想要一元字母和二元字母,那么这应该是 ngrams = 1:2
。
对于大多数问题,这应该都能很好地解决问题。如果您担心对象的大小,您可以循环遍历 dtm3
的各个选择,构建目标对象,或者 lapply()
比较如下(但这效率低得多) :
cosines <- lapply(docnames(corp2),
function(x) textstat_simil(dtm3[c(x, docnames(corp1)), ],
method = "cosine",
selection = x)[-1, , drop = FALSE])
do.call(cbind, cosines)
# B.1 B.2 B.3 B.4
# A.1 0.3333333 0.0000000 0.4082483 1.0000000
# A.2 0.4082483 0.0000000 0.0000000 0.0000000
# A.3 0.4082483 0.7071068 0.0000000 0.4082483
# A.4 0.0000000 0.5000000 0.0000000 0.0000000
我正在尝试计算一个文档术语矩阵的行与另一个文档术语矩阵的行的相似度。
A <- data.frame(name = c(
"X-ray right leg arteries",
"x-ray left shoulder",
"x-ray leg arteries",
"x-ray leg with 20km distance"
), stringsAsFactors = F)
B <- data.frame(name = c(
"X-ray left leg arteries",
"X-ray leg",
"xray right leg",
"X-ray right leg arteries"
), stringsAsFactors = F)
corp1 <- corpus(A, text_field = "name")
corp2 <- corpus(B, text_field = "name")
docnames(corp1) <- paste("A", seq_len(ndoc(corp1)), sep = ".")
docnames(corp2) <- paste("B", seq_len(ndoc(corp2)), sep = ".")
dtm3 <- rbind(dfm(corp1, ngrams=2), dfm(corp2, ngrams=2))
d1 = textstat_simil(dtm3, method = "cosine")
d1 = as.matrix(d1)
d1 = d1[grepl("^A.",row.names(d1)),grepl("^B.",colnames(d1))]
在代码中,我正在计算组合矩阵的相似度,然后从矩阵中删除不相关的单元格。是否可以在 textstat_simil(dtm3, method = "cosine")
中一次比较来自 A 的一份文档? table 下面是我要找的。当我使用 as.matrix(d1)
.
B.1 B.2 B.3 B.4
A.1 0.3333333 0.0000000 0.4082483 1.0000000
A.2 0.4082483 0.0000000 0.0000000 0.0000000
A.3 0.4082483 0.7071068 0.0000000 0.4082483
A.4 0.0000000 0.5000000 0.0000000 0.0000000
这会起作用,尽管正如您所指出的,它将 dist
class return 从 textstat_simil()
强制转换为 matrix
.
d2 <- textstat_simil(dtm3, method = "cosine", diag = TRUE)
as.matrix(d2)[docnames(corp1), docnames(corp2)]
# B.1 B.2 B.3 B.4
# A.1 0.3333333 0.0000000 0.4082483 1.0000000
# A.2 0.4082483 0.0000000 0.0000000 0.0000000
# A.3 0.4082483 0.7071068 0.0000000 0.4082483
# A.4 0.0000000 0.5000000 0.0000000 0.0000000
请注意,您在创建 dtm3
时使用 ngrams=2
将根据 仅 双字母特征(很少见)创建 dfm。如果您想要一元字母和二元字母,那么这应该是 ngrams = 1:2
。
对于大多数问题,这应该都能很好地解决问题。如果您担心对象的大小,您可以循环遍历 dtm3
的各个选择,构建目标对象,或者 lapply()
比较如下(但这效率低得多) :
cosines <- lapply(docnames(corp2),
function(x) textstat_simil(dtm3[c(x, docnames(corp1)), ],
method = "cosine",
selection = x)[-1, , drop = FALSE])
do.call(cbind, cosines)
# B.1 B.2 B.3 B.4
# A.1 0.3333333 0.0000000 0.4082483 1.0000000
# A.2 0.4082483 0.0000000 0.0000000 0.0000000
# A.3 0.4082483 0.7071068 0.0000000 0.4082483
# A.4 0.0000000 0.5000000 0.0000000 0.0000000