在 Excel 中导入未格式化的数据并强制使用杂乱的值作为列名

Importing unfriedly formatted data in Excel and forcing messy values as column names

我正在尝试使用以下代码导入一些公开可用的生活结果数据:

require(gdata)
# Source SIMD12 data zone level data
simd.sg.xls <- read.xls(xls = "http://www.gov.scot/Resource/0044/00447385.xls", 
                        sheet = "Quick Lookup", verbose = TRUE)

自然,导入的数据框看起来不太好: 我想使用以下代码修改我的列名:

# Clean column names
names(simd.sg.xls) <- make.names(names = as.character(simd.sg.xls[1,]),
                                    unique = TRUE,allow_ = TRUE)

但它会产生相当不愉快的结果:

> names(simd.sg.xls)
 [1] "X1"       "X1.1"     "X771"     "X354"     "X229"     "X74"      "X67"      "X33"      "X19"      "X1.2"    
[11] "X6"       "X1.3"     "X8"       "X7"       "X7.1"     "X6506"    "X21"      "X1.4"     "X6158"    "X6506.1" 
[21] "X6506.2"  "X6506.3"  "X6263"    "X6506.4"  "X6468"    "X1010"    "X815"     "X99"      "X58"      "X65"     
[31] "X60"      "X6506.5"  "X21.1"    "X1.5"     "X6173"    "X5842"    "X6506.6"  "X6506.7"  "X6263.1"  "X6506.8" 
[41] "X6481"    "X883"     "X728"     "X112"     "X69"      "X56"      "X54"      "X6506.9"  "X21.2"    "X1.6"    
[51] "X6143"    "X5651"    "X6506.10" "X6506.11" "X6263.2"  "X6506.12" "X6480"    "X777"     "X647"     "X434"    
[61] "X518"     "X246"     "X436"     "X6506.13" "X21.3"    "X1.7"     "X6136"    "X5677"    "X6506.14" "X6506.15"
[71] "X6263.3"  "X6506.16" "X660"     "X567"     "X480"     "X557"     "X261"     "X456"  

我的问题是是否有办法巧妙地将值从第一行强制到列名?由于我正在处理大量数据,因此我正在寻找易于重现的解决方案,我可以适应实际字符串的大量违规行为以获得语法正确的名称,但理想情况下我会避免使用复杂的正则表达式,因为我我经常阅读像此处链接的文件这样的文件,并且不想被迫为每次导入调整规则。

看起来问题是 header 在第二行,而不是第一行。您可以包含一个 skip=1 参数,但使用 read.xls 处理此问题的更通用方法似乎是使用 patternheader 参数强制第一行匹配pattern 字符串被视为 header。您的代码变为:

require(gdata)
# Source SIMD12 data zone level data
simd.sg.xls <- read.xls(xls = "http://www.gov.scot/Resource/0044/00447385.xls", 
                        sheet = "Quick Lookup", verbose = TRUE, 
                        pattern="DATAZONE", header=TRUE)

更新

我在执行代码时没有收到您发出的警告消息。这些消息指的是区域设置问题。我系统上的区域设置是:

Sys.getlocale()
[1] "LC_COLLATE=English_United States.1252;LC_CTYPE=English_United States.1252;LC_MONETARY=English_United States.1252;LC_NUMERIC=C;LC_TIME=English_United States.1252"

你的可能不一样。语言环境数据可能 OS 相关。我正在使用 Windows 8.1。我也在使用 Strawberry Perl;您似乎在使用其他东西。因此,警告消息存在差异的一些可能原因,但没有更具体的原因。

关于您评论中的第二个问题,要读取整个文件并将特定行(在本例中为第 2 行)转换为列名,您可以使用以下代码:

simd.sg.xls <- read.xls(xls = "http://www.gov.scot/Resource/0044/00447385.xls", 
                        sheet = "Quick Lookup", verbose = TRUE, 
                        header=FALSE, stringsAsFactors=FALSE)

   names(simd.sg.xls) <- make.names(names = simd.sg.xls[2,],
                                   unique = TRUE,allow_ = TRUE)
   simd.sg.xls <- simd.sg.xls[-(1:2),]

所有数据都是字符类型,因此您需要根据需要转换为因子和数字。