R ggiraph - 运行 .R 文件时无图

Question

如何在执行.R 文件时获取图表？文件 (test.r) 如下所示：

library(ggplot2)
library(ggiraph)
gg <- ggplot(data = mtcars, aes(x = mpg, y = wt, color = factor(cyl)))
gg1 <-  gg + geom_point_interactive(aes(tooltip = gear), size = 5)
ggiraph(code = print(gg1))

我正在运行使用此命令对其进行设置：

R < test.R --no-save

但是没有任何反应。如果我只是从命令行运行 R 并逐行输入代码，Firefox 打开并显示一个非常漂亮的图表，其中显示了所需的鼠标悬停标签。

R version 3.2.3 (2015-12-10)
x86_64-pc-linux-gnu

Answer 1

R 生成一个临时的 .html 文件，然后生成一个 gvfs-open 进程来查看该文件（进而打开 Firefox）。当您从命令行运行脚本时，R 会在 Firefox 进程有机会完全加载之前退出并清理其临时文件。你可以通过

看到效果

$ R -q --interactive < test.R
> library(ggplot2)
> library(ggiraph)
> gg <- ggplot(data = mtcars, aes(x = mpg, y = wt, color = factor(cyl)))
> gg1 <-  gg + geom_point_interactive(aes(tooltip = gear), size = 5)
> ggiraph(code = print(gg1))
Save workspace image? [y/n/c]: 
gvfs-open: /tmp/RtmpPxtiZi/viewhtml3814550ff070/index.html: error opening location:
Error when getting information for file '/tmp/RtmpPxtiZi/viewhtml3814550ff070/index.html': No such file or directory

一个简单的解决方法是在脚本末尾添加 Sys.sleep(5)。这会暂停 R 几秒钟，允许 gvfs-open 进程在浏览器 window 中完成打开您的临时文件，然后 R 退出并自行清理。

请注意 R 在 Sys.sleep() 之后退出时仍会删除临时 index.html 文件，但 Firefox 已经在内存中有一个缓存。

编辑：另一种解决方案是将您的交互式绘图显式写到 .html 文件中，该文件在 R 退出后仍然存在。您可以通过将 ggiraph 的结果存储到一个变量然后将其传递给 htmlwidgets::saveWidget:

myplot <- ggiraph(code = print(gg1))
htmlwidgets::saveWidget( myplot, "test.html" )
browseURL( "test.html" )

R ggiraph - 运行 .R 文件时无图

R ggiraph - no plot when running .R file

plot

r

ggiraph