希望节省 coordinates/layout 以使用 DRL 在 Igraph 中制作时间网络

Question

我想在 R 中创建时间网络，但我找到的唯一资源适用于 FR 或 KK 图。但是，我想作为布局基础的主要图表是 DRL 布局。我如何在 R 中对此进行编码以保持布局？

谢谢

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代码：

drl <- layout.drl(netfull, options=list(simmer.attraction=0))
plot(netfull, edge.arrow.size=2, vertex.size=.5, vertex.label.cex=.3, vertex.label.dist=.1, vertex.lable.degree=pi, layout=drl)
plot(net7, edge.arrow.size=2, vertex.size=.5,vertex.label.cex=.3, vertex.label.dist=.1, vertex.lable.degree=pi, layout=drl)

Answer 1

您可以在绘图前明确计算您的布局，然后在您想要绘图时使用 layout 参数。 DRL 是 igraph 提供的标准选项之一。

library(igraph)

## create test graph
set.seed(1234)
g = erdos.renyi.game(15, 0.2, type = "gnp")

## Create a reusable layout for the graph
LO = layout_with_drl(g)

## plot using the layout
plot(g, layout=LO)

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根据评论中的讨论，我对这个问题有了不同的理解。我认为问题是这样的：给定一个图 g 和一个子图 g2 在同一位置打印 g 和 g2 以及相应的节点。这个额外的回应解决了这个问题。

Start with the example above to create the graph g and the layout LO.

现在我们要取一个子图并在同一个地方打印相应的节点。我将使用通过删除节点 2、9 和 15 获得的图作为示例。

如果我们简单地删除这些节点，新图将有 12 个节点，它们的节点 ID 为 1-12。为了保留原始编号，我们需要将节点 ID 保存为标签。

V(g)$label = 1:15

现在让我们通过删除节点 2,9 和 15 来创建子图。

g2  = induced_subgraph(g, V(g)[-c(2,9,15)])

我们想重用布局LO，但是LO有所有15个原始节点的位置。我们只想 select g2 中剩余节点的部分。

LO2 = LO[-c(2,9,15),]

现在我们准备绘制原始图和缩减图，使节点对齐。

par(mfrow=c(1,2), mar=c(2,1,2,1))
plot(g, layout=LO, frame=TRUE)
plot(g2, layout=LO2, frame=TRUE)

希望节省 coordinates/layout 以使用 DRL 在 Igraph 中制作时间网络

Looking to save coordinates/layout to make temporal networks in Igraph with DRL

networking

r

temporal

igraph

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