有没有办法在 Tensorflow 的另一个数据集中使用 tf.data.Dataset?
Is there a way to use tf.data.Dataset inside of another Dataset in Tensorflow?
我在做分割。每个训练样本都有多个带有分割掩码的图像。我正在尝试编写 input_fn
以将每个训练样本的所有蒙版图像合并为一个。
我计划使用两个 Datasets
,一个遍历样本文件夹,另一个将所有掩码作为一个大批量读取,然后将它们合并为一个张量。
调用嵌套 make_one_shot_iterator
时出现错误。我知道这种方法有点牵强,而且很可能数据集不是为这种用途而设计的。但是我应该如何解决这个问题,以避免使用 tf.py_func?
这是数据集的简化版本:
def read_sample(sample_path):
masks_ds = (tf.data.Dataset.
list_files(sample_path+"/masks/*.png")
.map(tf.read_file)
.map(lambda x: tf.image.decode_image(x, channels=1))
.batch(1024)) # maximum number of objects
masks = masks_ds.make_one_shot_iterator().get_next()
return tf.reduce_max(masks, axis=0)
ds = tf.data.Dataset.from_tensor_slices(tf.glob("../input/stage1_train/*"))
ds.map(read_sample)
# ...
sample = ds.make_one_shot_iterator().get_next()
# ...
如果嵌套数据集只有一个元素,您可以在嵌套数据集上使用 tf.contrib.data.get_single_element()
而不是创建迭代器:
def read_sample(sample_path):
masks_ds = (tf.data.Dataset.list_files(sample_path+"/masks/*.png")
.map(tf.read_file)
.map(lambda x: tf.image.decode_image(x, channels=1))
.batch(1024)) # maximum number of objects
masks = tf.contrib.data.get_single_element(masks_ds)
return tf.reduce_max(masks, axis=0)
ds = tf.data.Dataset.from_tensor_slices(tf.glob("../input/stage1_train/*"))
ds = ds.map(read_sample)
sample = ds.make_one_shot_iterator().get_next()
此外,您可以使用 tf.data.Dataset.flat_map()
, tf.data.Dataset.interleave()
, or tf.contrib.data.parallel_interleave()
转换在函数内执行嵌套 Dataset
计算,并将结果展平为单个 Dataset
。例如,要在单个 Dataset
:
中获取所有样本
def read_all_samples(sample_path):
return (tf.data.Dataset.list_files(sample_path+"/masks/*.png")
.map(tf.read_file)
.map(lambda x: tf.image.decode_image(x, channels=1))
.batch(1024)) # maximum number of objects
ds = tf.data.Dataset.from_tensor_slices(tf.glob("../input/stage1_train/*"))
ds = ds.flat_map(read_all_samples)
sample = ds.make_one_shot_iterator().get_next()
我在做分割。每个训练样本都有多个带有分割掩码的图像。我正在尝试编写 input_fn
以将每个训练样本的所有蒙版图像合并为一个。
我计划使用两个 Datasets
,一个遍历样本文件夹,另一个将所有掩码作为一个大批量读取,然后将它们合并为一个张量。
调用嵌套 make_one_shot_iterator
时出现错误。我知道这种方法有点牵强,而且很可能数据集不是为这种用途而设计的。但是我应该如何解决这个问题,以避免使用 tf.py_func?
这是数据集的简化版本:
def read_sample(sample_path):
masks_ds = (tf.data.Dataset.
list_files(sample_path+"/masks/*.png")
.map(tf.read_file)
.map(lambda x: tf.image.decode_image(x, channels=1))
.batch(1024)) # maximum number of objects
masks = masks_ds.make_one_shot_iterator().get_next()
return tf.reduce_max(masks, axis=0)
ds = tf.data.Dataset.from_tensor_slices(tf.glob("../input/stage1_train/*"))
ds.map(read_sample)
# ...
sample = ds.make_one_shot_iterator().get_next()
# ...
如果嵌套数据集只有一个元素,您可以在嵌套数据集上使用 tf.contrib.data.get_single_element()
而不是创建迭代器:
def read_sample(sample_path):
masks_ds = (tf.data.Dataset.list_files(sample_path+"/masks/*.png")
.map(tf.read_file)
.map(lambda x: tf.image.decode_image(x, channels=1))
.batch(1024)) # maximum number of objects
masks = tf.contrib.data.get_single_element(masks_ds)
return tf.reduce_max(masks, axis=0)
ds = tf.data.Dataset.from_tensor_slices(tf.glob("../input/stage1_train/*"))
ds = ds.map(read_sample)
sample = ds.make_one_shot_iterator().get_next()
此外,您可以使用 tf.data.Dataset.flat_map()
, tf.data.Dataset.interleave()
, or tf.contrib.data.parallel_interleave()
转换在函数内执行嵌套 Dataset
计算,并将结果展平为单个 Dataset
。例如,要在单个 Dataset
:
def read_all_samples(sample_path):
return (tf.data.Dataset.list_files(sample_path+"/masks/*.png")
.map(tf.read_file)
.map(lambda x: tf.image.decode_image(x, channels=1))
.batch(1024)) # maximum number of objects
ds = tf.data.Dataset.from_tensor_slices(tf.glob("../input/stage1_train/*"))
ds = ds.flat_map(read_all_samples)
sample = ds.make_one_shot_iterator().get_next()