从嵌套目录读取 .dcm 文件

Question

这是我的嵌套目录的形式：

/data/patient_level/study_level/series_level/

对于每个patient_level文件夹，我需要从相应的“[=]读取“.dcm”文件26=]series_level”文件夹。

如何访问 "series_level" 文件夹中的“.dcm”文件？

我需要 DICOM 对象的 3 个特征。

这是我的源代码：

import dicom
record = dicom.read_file("/data/patient_level/study_level/series_level/000001.dcm")
doc = {"PatientID": record.PatientID, "Manufacturer": record.Manufacturer, "SeriesTime": record.SeriesTime}

然后，我会将此文档插入 Mongo 数据库。

如有任何建议，我们将不胜感激。提前致谢。

Answer 1

我们不确定您要解决什么问题，也不确定您是否向我们询问，但如果您只想从 data 目录中获取所有 *.dcm 文件的列表，您可以轻松使用 Python 3 的 pathlib.Path：

from pathlib import Path
data = Path('/data')
list(data.glob('**/*.dcm'))

从嵌套目录读取 .dcm 文件

Reading .dcm files from a nested directory

python

directory

pydicom