来自 AllenSDK 的 运行 细胞类型笔记本时出现类型错误

Question

我是运行第一行cell types notebook:

sweep_number = 30
sweep_data = data_set.get_sweep(sweep_number)

我收到这个错误：

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TypeError                                 Traceback (most recent call last)
<ipython-input-8-1ff88b13fc24> in <module>()
      4 
      5 sweep_number = 30
----> 6 sweep_data = data_set.get_sweep(sweep_number)
      7 

C:\ProgramData\Anaconda3\lib\site-packages\allensdk\core\nwb_data_set.py in get_sweep(self, sweep_number)
    112                 unit = stimulus_dataset.attrs["unit"]
    113                 unit_str = None
--> 114                 if unit.startswith('A'):
    115                     unit_str = "Amps"
    116                 elif unit.startswith('V'):

TypeError: startswith first arg must be bytes or a tuple of bytes, not str

Answer 1

您看到的错误是由于 unit 变量是一个字节文字，而 allensdk 试图使用其上的字符串调用 endswith。这行不通，但这不是你的错。这是从 Python 2 迁移到 Python 3 时的常见错误（它引入了字节类型；有关详细信息，请参阅 here）。我猜你是 运行 Python 3 这会导致错误，因为 allensdk 无法在此处处理字节。

要解决此问题，您要么必须安装 Python 2，因为您使用的是 conda，请创建一个使用 Python 2 的环境。这可以按如下方式完成：

> conda create -n py2allen python=2.7
> activate py2allen
(py2allen)> pip install allensdk
(py2allen)> jupyter notebook

可以找到更多信息 here。 如果有些需求没有找到，可以尝试手动安装。