Docker 和 Conda:在 Mac 和 Ubuntu 上构建相同容器时的差异

Docker and Conda: Differences when building the same container on Mac and on Ubuntu

我正在使用 Docker 构建一个 Python 容器,目的是在几台机器上拥有一个可重现的环境,这些机器是一堆开发 Mac 书籍和几本AWS EC2 服务器。

容器基于continuumio/miniconda3,即Docker文件以

开头
FROM continuumio/miniconda3

几天前 在 Ubuntu Docker 文件中的 conda installconda upgrade 命令抱怨一个新的Conda 版本 (4.11) 可用:

==> WARNING: A newer version of conda exists. <==
  current version: 4.4.10
  latest version: 4.4.11

  Please update conda by running

  $ conda update -n base conda

如果我忽略它,软件包安装将退出并出现错误:

Downloading and Extracting Packages
The command '/bin/sh -c conda install -y pandas=0.22.0 matplotlib 
scikit-learn=0.19.1 pathos lazy openpyxl pytables dill pydro psycopg2 
sqlalchemy pyarrow arrow-cpp parquet-cpp scipy tensorflow keras 
xgboost' returned a non-zero code: 1

当我将这个 conda update... 添加到 Docker 文件时,事情又恢复了。

然而,真正烦人的是 运行 在 Ubuntu 上的更新在 Mac Docker[= 上不起作用45=]。我收到以下错误:

CondaEnvironmentNotFoundError: Could not find environment: base .
You can list all discoverable environments with `conda info --envs`.

请注意,当我 docker build 与在 Ubuntu 机器上运行的相同 Docker 文件时出现此错误,这破坏了使用 [=49= 的全部意义] 首先。在 Mac 上,旧版本的文件(没有 conda update -n base conda)仍然 运行 可以并安装所有软件包。

Docker / Conda 专家,有什么想法吗?

编辑: 这是完整的 Docker 文件(在 Ubuntu 中有效的文件):

# Use an official Python runtime as a parent image
FROM continuumio/miniconda3

WORKDIR /app/dev/predictive.analytics

RUN apt-get update; \
apt-get install -y gcc tmux htop

RUN conda update -y -n base conda

RUN conda config --add channels babbel; \
conda config --add channels conda-forge; 

RUN conda install -y pandas=0.22.0 matplotlib scikit-learn=0.19.1 pathos lazy openpyxl pytables dill pydro psycopg2 sqlalchemy pyarrow arrow-cpp parquet-cpp scipy tensorflow keras xgboost
RUN pip install recordclass sultan
RUN conda upgrade -y python 

ENV DATA_DIR /host/data
ENV PYTHONPATH /host/predictive.analytics/python
ENV PATH="/host/predictive.analytics:${PATH}"

也许您在其中一台构建机器上使用了过时的 miniconda,请尝试 docker build --pull --no-cache

Docker 不一定会从存储库中提取最新的映像,因此除非您执行 --pull,否则您的某些机器可能会使用过时的基础映像开始构建。