将变量传递给 R 中的 WinBugs 模型

Question

我正在使用 R2WinBugs 包。我想将之前在 R 脚本中计算的两个参数传递给模型函数

c0yy <- 0.1
syy <- 0.0001
#Model
model <- function(c0yy,syy){

  #Likelihood
  for(i in 1:n){
    y[i] ~ dnorm(mu[i],cyy)
  }

  #Regression formula
  for(i in 1:n){
    mu[i] <- alpha + gamma * x[i]
  }

  #Priors for the regression parameters
  alpha ~ dnorm(0,0.000001)
  gamma ~ dnorm(0,0.000001)

  #Priors for the precision parameter
  cyy ~ dnorm(c0yy,syy)

  #Monitored variables
  beta <- gamma/(alpha-1)  
}
filename <- file.path(tempdir(), "Olm.txt")
write.model(model, filename)

但是我得到这个错误

made use of undefined node c0yy

而如果我在模型函数中替换 c0yy 和 syy 的值，它就可以工作。有什么帮助吗？

谢谢

Answer 1

您绑定传递给模型的值是数据。在 BUGS（和 R2WinBUGS）中，数据作为独立于您定义的模型的实体传递给程序。为了包含数据，您可以将它们放入列表中，例如；

my.mcmc <- bugs(data = list(c0yy = 0.1, syy= 0.0001), params = "beta', model.file = "Olm.txt", n.iter=10000)

您还需要从模型脚本中删除 <- function(c0yy,syy)。

将变量传递给 R 中的 WinBugs 模型

Passing variable to WinBugs model in R

r

winbugs

r2winbugs