无法通过 SSH 在 R 中连接到 MySQL 服务器

Question

背景

我正在尝试从云 MySQL 服务器中提取数据。我只是将数据库从共享服务器移动到专用云服务器。在旧位置一切正常。新位置需要 SSH 隧道。

Research/Info:

我发现的所有相似之处是。它并不适用，因为我从未使用过本地主机。

我可以在Sequel Pro和MySQL Workbench中使用相同的凭据成功连接，但我无法获得打球的R脚本。

我可以在命令行中连接到mysql。

我没有在本地安装mysql。（除非它与 High Sierra 一起发布；我不知道。无论如何，如果有本地 MySQL 实例，则它不是运行。）

代码：

这是失败的原因：

con <- dbConnect(RMariaDB::MariaDB(),
                 user = 'soundings_app',
                 password = keyringr::decrypt_kc_pw("Soundings_app"),
                 host = '127.0.0.1',
                 port = 3306,
                 dbname='UFO')

我也试过使用实际密码作为字符串，但得到了同样的错误。

错误信息

Error in connection_create(host, username, password, dbname, as.integer(port),  : 
  Failed to connect: Can't connect to MySQL server on '127.0.0.1' (57)

我唯一的猜测

我唯一能想到的是 SequelPro 和 Workbench 都有一个地方可以输入我的私钥位置 (~/.ssh)。

你能解释一下我做错了什么吗？

更新

我将主机添加到我的 ./ssh/config 文件中，如下所示：

Host XXX.XXX.130.0
  LocalForward 3306 localhost:3306

这导致我的其他连接失败，所以我删除了它。但是当我尝试连接 ~/.ssh/config 时，Sequel Pro 给了我以下信息：

Used command:  /usr/bin/ssh -v -N -S none -o ControlMaster=no -o ExitOnForwardFailure=yes -o ConnectTimeout=10 -o NumberOfPasswordPrompts=3 -i /Users/steves2018air/.ssh/id_rsa -o TCPKeepAlive=no -o ServerAliveInterval=60 -o ServerAliveCountMax=1 ubuntu@XXX.XXX.130.0 -L 49700:127.0.0.1:3306

OpenSSH_7.6p1, LibreSSL 2.6.2
debug1: Reading configuration data /Users/steves2018air/.ssh/config
debug1: /Users/steves2018air/.ssh/config line 1: Applying options for XXX.XXX.130.0
debug1: Reading configuration data /etc/ssh/ssh_config
debug1: /etc/ssh/ssh_config line 48: Applying options for *
debug1: Control socket " none" does not exist
debug1: Connecting to XXX.XXX.130.0 [XXX.XXX.130.0] port 22.
debug1: fd 3 clearing O_NONBLOCK
debug1: Connection established.
debug1: identity file /Users/steves2018air/.ssh/id_rsa type 0
debug1: key_load_public: No such file or directory
debug1: identity file /Users/steves2018air/.ssh/id_rsa-cert type -1
debug1: Local version string SSH-2.0-OpenSSH_7.6
debug1: Remote protocol version 2.0, remote software version OpenSSH_7.2p2 Ubuntu-4ubuntu2.4
debug1: match: OpenSSH_7.2p2 Ubuntu-4ubuntu2.4 pat OpenSSH* compat 0x04000000
debug1: Authenticating to XXX.XXX.130.0:22 as 'ubuntu'

更新二

一时兴起，我尝试将主机从“127.0.0.1”更改为 'localhost'，只是想看看会发生什么，以及是否有任何启示。略有不同的错误：

Error in connection_create(host, username, password, dbname, as.integer(port),  : 
  Failed to connect: Can't connect to local MySQL server through socket '/tmp/mysql.sock' (2)

仍然没有解决方案或解释 — 你能帮忙吗？

Answer 1

我花了很长时间，但这是我解决这个问题的方法：

我将此添加到 /etc/mysql/。my.cnf:

[destination]
 user=`username`
 port=3308
 proto=TCP

然后我使用以下方式连接到云服务器：

ssh ubuntu@xxx.xxx.xxx.x -L 3308:127.0.0.1:3306

我可以运行在 R 之外的终端 window 中，或者我可以运行在 RStudio 中的终端 window 中 - 无论哪种方式，以下作品：

con <- dbConnect(RMariaDB::MariaDB(),
                 user = '`username`',
                 password = decrypt_kc_pw("`pw_profile_name`"),
                 groups = "destination",
                 default.file = "/etc/mysql/.my.cnf",
                 host = '127.0.0.1',
                 port = 3308,
                 dbname='`db_name`')

Answer 2

史蒂夫，谢谢你 - 它对我来说很完美 - 经过一些小的改动。

我的保存在 /etc/mysql/mariadb.cnf 文件中。

con <- dbConnect(RMariaDB::MariaDB(),
user = "yourusername",
password = "yourpassword",
groups = "destination",
default.file = "/etc/mysql/mariadb.cnf",
host = '127.0.0.1',
port = 3308,
dbname="yourdb_name")

无法通过 SSH 在 R 中连接到 MySQL 服务器

Can't Connect in R to MySQL Server through SSH

mysql

ssh

r

r-dbi

背景

Research/Info:

代码：

错误信息

我唯一的猜测

更新

更新二