如何在mysql中的table中插入大蛋白序列？

Question

我正在创建一个蛋白质数据库，其中包含大量蛋白质序列。我创建了四个表，其中一个存储了 genomeID、sequenceID、name 和 sequence。我可以使用 INSERT INTO 命令 MySQL 轻松存储其他值，但我对以 ​​fasta 格式插入这些大蛋白质序列感到震惊，因为一个基因组有数千个肽序列。 我想找出一种可以使用 MySQL.

存储这些序列的方法

如有任何帮助，我们将不胜感激！ 谢谢

Answer 1

鉴于基因组包含数十亿个字符这一事实，将其存储在 sql 数据库中是不可行的，因为即使是最长的数据类型也最多可以容纳大约 1000 个字符。相反，我建议使用 NoSQL key-value 数据库来存储您的序列。