如何在不调整大小和不修改颜色的情况下查看此 .fits 图像？

Question

我正在尝试从 '.fits' 文件中打开全彩图像。但是，当将它与相应的 '.gif' 图像进行比较时，它的颜色和大小似乎有误。

如何以正确的尺寸查看真彩色图像？

举个例子，可以select'.fits'文件和对应的'.gif'文件located at the top of this webpage. My example code, which uses the APLPY模块，如下。

def from_fits_to_image(color_scheme, rloc, rname='synop_Ml_0.2104', rext='.fits', cmap=None):
    """ 
    color_scheme : 'rgb', 'grayscale', or 'false color'; color scheme of image to be shown
    rloc         : type <str>; location of file to be read
    rname        : type <str>; name of file to be read
    rext         : type <str>; extension of file to be read
    cmap         : None or type <str>; colormap
    """
    rpath = rloc + rname + rext
    if color_scheme == 'rgb':
        pic = aplpy.FITSFigure(rpath)
        # pic.show_rgb(alt_filename) # what filename is supposed to go here?
    else:
        pic = aplpy.FITSFigure(rpath)
        if color_scheme == 'grayscale':
            pic.show_grayscale()
        elif color_scheme == 'false color':
            if cmap is None:
                pic.show_colorscale()
            else:
                pic.show_colorscale(cmap=cmap)
    # plt.savefig(...)
    plt.show()

只要提供正确的rloc（下载'.fits'文件的位置）和color_scheme，上面的代码就会运行。

调用下面的函数将显示适当尺寸的空图。要使其非空，我必须提供另一个现有的文件名，但我不清楚它到底应该是什么。

from_fits_to_image(color_scheme='rgb', rloc=rloc)

下面的每个函数调用都会显示一个已调整为较小的图。虽然 color_scheme='grayscale' 似乎可以正确地为图着色，但其他方法不能正确地为图像着色。

from_fits_to_image('grayscale', rloc=rloc)

from_fits_to_image('false color', rloc=rloc)

from_fits_to_image('false color', rloc=rloc, cmap='plasma')

为了比较，'.gif' 图像如下。理想情况下，输出看起来与下图完全一样。

编辑：

我曾尝试使用 astropy、PIL 和 pyfits，但均未成功。任何帮助将不胜感激。

编辑 2：

下面是使用 astropy.io 中的 fits 的结果。

from astropy.io import fits

def reada(rloc, rname='synop_Ml_0.1998', rext='.fits'):
    """ """
    rpath = rloc + rname + rext
    # hdu_list = fits.open(rpath)
    # hdu_list.info()
    pic = fits.getdata(rpath)
    plt.imshow(pic)
    plt.show()

reada(rloc=rloc)

我玩过 vmin 和 vmax kwargs，但没有成功。此外，使用 pyfits 打开文件会导致以下错误，即使使用 pyfits.open(rpath, uint=True, do_not_scale_image_data=True):

TypeError: Image data can not convert to float

Answer 1

从动图来看，好像是false-color一张，关键是要选对色图。我不能说 python 中是否有与您链接到的颜色图等效的颜色图，但我们可以找到非常接近的东西，重新创建图像中的所有特征：

fig = aplpy.FITSFigure('synop_Ml_0.2104.fits')
fig.show_colorscale(vmin=-60, vmax=60, cmap='hot')

显示以下内容（请注意，aplpy 不理解此坐标系，因此它以像素坐标绘制图形）：

问题的第二部分比较棘手，我无法完全回答。首先，您需要将卡林顿时间转换为经度，将正弦纬度转换为度数，然后绘制轴标签的新值而不是旧值，或者作为寄生轴与旧值并列（您可以参考寄生虫轴示例 here).

现在看起来卡林顿时间自 1853 年 11 月 9 日以来只是旋转了度数，并且 x-axis 正好跨越 360，所以我假设转换只是偏移了 757079.95，x-axis 左边缘的值。我们可以double-check它在世界坐标上，通过查看地图的像素跨度如何对应坐标跨度：

In [88]: fig._wcs.wcs_pix2world(fig._ax1.get_xlim(), fig._ax1.get_ylim(), origin=1)
Out[88]: [array([757439.95, 757079.95]), array([-1.,  1.])]

x 轴边的值差 757079.95 和 757439.95 正好是 360 度。

那么我们可以使用一些 matplotlib 技巧来手动偏移坐标值以强制它们从 0 变为 360 并使 x 轴与您的 gif 图像匹配：

# using hidden attributes is non-pythonic but aplpy does not leave us other options
ax = fig._ax1
x_range = ax.get_xlim()
new_ticklabels = np.arange(60, 361, 60)
new_tick_positions = new_ticklabels / 360. * x_range[1] + x_range[0]
ax.set_xticks(new_tick_positions)
ax.set_xticklabels(new_ticklabels)
fig.axis_labels.set_xtext('Carrington Longitude')

请记住，aplpy 是一个设计用于绘制天体坐标而非太阳坐标的库，因此让轴变换正常工作可能是一个相当痛苦的过程。另一种方法，也许是更好的方法，是用 sunpy 绘制拟合文件，一个 python library 用于太阳物理学。但是，我从未使用过它，它似乎会为这个特定的适合文件抛出错误。看起来您需要修改 fits 文件的 header 才能正确读取坐标。如果您想使用该库，也许您可以联系 sunpy 社区？

如何在不调整大小和不修改颜色的情况下查看此 .fits 图像？

How to view this .fits image without resizing and without modifying colors?

python

python-imaging-library

python-3.x

fits

aplpy