使用 broom (augment) 和 dplyr with loess fit 时出错

Question

我正在尝试对黄土拟合使用扩充，但收到以下错误：

Error in data.frame(..., check.names = FALSE) : 
  arguments imply differing number of rows: 32, 11

在报错信息中，11恰好等于一个片段中的观测数，而32是总观测数。代码如下。

require(broom)
require(dplyr)

# This example uses the lm method and it works
regressions <- mtcars %>% group_by(cyl) %>%  do(fit = lm(wt ~ mpg, .))
regressions %>% augment(fit)

# This example uses the loess method and it generates the error
regressions2 <- mtcars %>% group_by(cyl) %>%  do(fit = loess(wt ~ mpg, .))
regressions2 %>% augment(fit)

# The below code appropriately plots the loess fit using geom_smooth. 
# My current # workaround is to do a global definition as an aes object in geom_smooth`
cylc = unique(mtcars$cyl) %>% sort()
for (i in 1:length(cyl)){
  print(i)
  print(cyl[i])
  p<- ggplot(data=filter(mtcars,cyl==cylc[i]),aes(x=mpg,y=wt)) + geom_point() + geom_smooth(method="loess") + ggtitle(str_c("cyl = ",cyl[i]))
  print(p)
}

Answer 1

这似乎是与 do() 运算符相关的问题：当我们检查 LOESS 模型对象之一的 model.frame() 时，我们得到所有 32 行而不是对应于那个型号。

解决方法是保留数据而不仅仅是模型，并将其作为第二个参数传递给 augment():

regressions2 <- mtcars %>%
  group_by(cyl) %>%
  do(fit = loess(wt ~ mpg, .),
     data = (.)) %>%
   augment(fit, data)

无论如何，这通常与 augment() 一起推荐，因为 model.frame() 无法获得所有原始列。

顺便说一下，我是 broom 的维护者，我通常不再推荐 do() 方法（因为 dplyr 大部分时间都在远离它）。

相反，我建议使用 tidyr 的 nest() 和 purrr 的 map()，如 this chapter of R4DS 中所述。这使得保留数据并合并到 augment().

中变得更容易一些

library(tidyr)
library(purrr)

mtcars %>%
  nest(-cyl) %>%
  mutate(fit = map(data, ~ loess(wt ~ mpg, .))) %>%
  unnest(map2(fit, data, augment))

使用 broom (augment) 和 dplyr with loess fit 时出错

Error when using broom (augment) and dplyr with loess fit

r

dplyr

broom