在 lme4 中隐藏警告消息

Question

我在运行 lmer 时收到此警告消息。我知道为什么会这样。有什么方法可以隐藏它吗？

fixed-effect model matrix is rank deficient so dropping 1 column / coefficient

Answer 1

这是一条消息（：警告使用前缀Warning message:），因此您可以使用suppressMessages():

library(lme4)
ss <- transform(sleepstudy,Days2=Days)  ## create duplicate variable
m1 <- lmer(Reaction~Days+Days2+(1|Subject),ss)
## fixed-effect model matrix is rank deficient so dropping 1 column / coefficient
m2 <- suppressMessages(lmer(Reaction~Days+Days2+(1|Subject),ss))

但是，您可以通过包含 control=lmerControl(check.rankX="silent.drop.cols") 告诉 lmer 抑制仅此消息:

m3 <- update(m1, control=lmerControl(check.rankX="silent.drop.cols"))

总的来说，我会说如果可能的话，最好首先避免模型中的这些共线项（尽管它们是无害的）。（我看到 OP 说他们知道发生了什么，所以这个信息更适合未来的读者。）您可以通过查看模型矩阵的属性来了解哪些变量被删除：

attr(getME(m2,"X"),"col.dropped")
## Days2 
#3    3

在 lme4 中隐藏警告消息

Hide warning message in lme4

r

lme4