SAS:PROC FREQ 自动组合?

SAS: PROC FREQ combinations automatically?

我有一个看起来像下面 table 的患者数据集,我想一起查看哪些疾病 运行 并最终制作一个 热图 。我使用 PROC FREQ 制作了这个列表 table,但是像这样完成它太费力了,因为它给了我每个组合(数千)。

Moya    Hypothyroid Hyperthyroid    Celiac
   1       1           0             0
   1       1           0             0       
   0       0           1             1
   0       0           0             0
   1       1           0             0
   1       0           1             0
   1       1           0             0
   1       1           0             0
   0       0           1             1
   0       0           1             1


proc freq data=new;
tables HOHT*HOGD*CroD*Psor*Viti*CelD*UlcC*AddD*SluE*Rhea*PerA/list;
run;

我最终想要一堆交叉表,如下所示,这样我就可以看到每个组合有多少患者。显然可以像这样手动复制粘贴每个变量,但是有什么方法可以快速查看或自动执行此操作?

proc freq data=new;
tables HOHT*HOGD/list;
run;

proc freq data=new;
tables HOHT*CroD/list;
run;


proc freq data=new;
tables HOHT*Psor/list;
run;

谢谢!

可以使用TABLES 语句控制在PROC FREQ 中生成的表。要生成数据集中所有列对的 2-way 列联表,可以编写一个 SAS 宏来循环变量列表,并生成 TABLES 语句来创建所有正确的列联表.

例如,使用原始post中的数据:

data xtabs;
input Moya    Hypothyroid Hyperthyroid    Celiac;
datalines;
   1       1           0             0
   1       1           0             0       
   0       0           1             1
   0       0           0             0
   1       1           0             0
   1       0           1             0
   1       1           0             0
   1       1           0             0
   0       0           1             1
   0       0           1             1
;
run;
%macro gentabs(varlist=);
   %let word_count = %sysfunc(countw(&varlist));
   %do i = 1 %to (&word_count - 1);
      tables %scan(&varlist,&i,%str( )) * (
      %do j = %eval(&i + 1) %to &word_count;
        %scan(&varlist,&j,%str( ))
      %end; )
      ; /* end tables statement */
   %end;
%mend;
options mprint;
proc freq data = xtabs;
  %gentabs(varlist=Moya Hypothyroid Hyperthyroid Celiac)
  run;

SAS宏生成的代码为:

 73         proc freq data = xtabs;
 74           %gentabs(varlist=Moya Hypothyroid Hyperthyroid Celiac)
 MPRINT(GENTABS):   tables Moya * ( Hypothyroid Hyperthyroid Celiac ) ;
 MPRINT(GENTABS):   tables Hypothyroid * ( Hyperthyroid Celiac ) ;
 MPRINT(GENTABS):   tables Hyperthyroid * ( Celiac ) ;
 75         run;

...结果输出的前几张表如下所示:

要向 TABLES 语句添加选项,可以在注释为 /* end tables statement */ 的行的分号前添加代码。

Proc MEANS 是一种常用工具,用于获取数据中组合组的各种统计信息。在您的情况下,您只需要每个组合的计数。

假设您有 10,000 名具有 10 个二元因素的患者

data patient_factors;
  do patient_id = 1 to 10000;
    array factor(10);
    do _n_ = 1 to dim(factor);
      factor(_n_) = ranuni(123) < _n_/(dim(factor)+3);
    end;
    output;
  end;
  format factor: 4.;
run;

正如您提到的,Proc FREQ 可以计算每个 10 级组合的计数。

proc freq noprint data=patient_factors;
  table 
    factor1
    * factor2 
      * factor3
        * factor4
          * factor5
            * factor6
              * factor7
                * factor8
                  * factor9
                    * factor10
  / out = pf_10deep
  ;
run;

FREQ 没有支持创建包含涉及 factor1.

的每个成对组合的输出数据的语法

Proc MEANS 是否具有此类输出的语法。

proc means noprint data=patient_factors;
  class factor1-factor10;
  output out=counts_paired_with_factor1 n=n;
  types factor1 * ( factor2 - factor10 );
run;