SPARQL 查询不工作 - SNOMED-CT ontology

Question

我正在尝试执行一个非常简单的 SPARQL 查询，以根据查询字符串中传递的名称使用 https://bioportal.bioontology.org/ontologies/SNOMEDCT/?p=classes&conceptid=root（在 Java 中）检索有关特定疾病的信息，但我没有不明白为什么它不起作用。以下是相关代码：

PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>

SELECT DISTINCT *
FROM <http://bioportal.bioontology.org/ontologies/SNOMEDCT>
FROM <http://bioportal.bioontology.org/ontologies/globals>
WHERE
{
    ?x rdfs:label ?label .
    FILTER (CONTAINS ( UCASE(str(?label)), "MELANOMA") )
}

Answer 1

在 BioPortal 上的 SNOMED-CT 中唯一出现 rdfs:label 的是 snomed-term: rdfs:label "SNOMEDCT"。 BioPortal uses skos:prefLabel (which is a subproperty of rdfs:label) 而不是。

试试这个查询：

PREFIX skos: <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#>
PREFIX snomed-term: <http://purl.bioontology.org/ontology/SNOMEDCT/>

SELECT DISTINCT *
FROM <http://bioportal.bioontology.org/ontologies/SNOMEDCT>
FROM <http://bioportal.bioontology.org/ontologies/globals>
WHERE {
    ?x skos:prefLabel ?label .
    FILTER (CONTAINS ( UCASE(str(?label)), "MELANOMA") )
}

应该有 10 个结果。

如果您需要将结果限制为疾病，您可能需要将 ?x rdfs:subClassOf+ snomed-term:64572001 添加到查询中。但不幸的是，BioPortal SPARQL 端点似乎不支持 SPARQL 1.1 属性路径。

SPARQL 查询不工作 - SNOMED-CT ontology

SPARQL query not working - SNOMED-CT ontology

ontology

sparql

snomed-ct