运行 Python 中的 R 脚本

Question

我是运行 python 中的一个简单 R 脚本，使用以下代码。

import rpy2.robjects as robjects
r=robjects.r
output = r.source("sample.R")

现在当我打印输出时

print (output)

我只是将脚本的最后一个变量作为输出，而不是所有变量（这是我没有预料到的。我也在想如果我调用 c 或数据，结果将被打印出来，但是 python 没有识别这些用 R 编码的变量）。我不确定如何调用所有这些变量。

我正在用 R 脚本编写非常简单的代码只是为了测试。我的 R 脚本如下所示：

a <- 1
b <- 3
c <- a + b 
data = 1:20

现在调用脚本并打印结果时，我在输出中得到以下内容。我不确定发生了什么。

$value

 [1]  1  2  3  4  5  6  7  8  9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20



$visible

[1] FALSE

我不确定如何准确打印从 R 到 python 的变量。请指导我。您的帮助将不胜感激。

此致

Answer 1

你的变量output将只存储源文件的输出，这正是你得到的，id est最后一个变量。但是所有变量实际上都存在于某个地方，在 R 环境中，您可以使用 robjects.globalenv 获得。知道您可以轻松检索在 R 中创建的每个变量的值：

import rpy2.robjects as robjects
robjects.r.source("sample.R")
print(robjects.globalenv["a"])
print(robjects.globalenv["b"])
print(robjects.globalenv["c"])
print(robjects.globalenv["data"])

运行 Python 中的 R 脚本

Running R script in Python

python

r

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