mpi4py

Question

我正在编写一个简单的 python 脚本来测试 mpi4py。具体来说，我想从给定的处理器（比如 rank 0）广播一个标量和一个数组，以便所有其他处理器在后续步骤中都可以访问广播的标量和数组的值。

这是我到目前为止所做的：

from __future__ import division
from mpi4py import MPI
import numpy as np

comm = MPI.COMM_WORLD
nproc = comm.Get_size()
rank = comm.Get_rank()

if rank==0:
    scal = 55.0
    mat = np.array([[1,2,3],[4,5,6],[7,8,9]])

    arr = np.ones(5)
    result = 2*arr

    comm.bcast([ result , MPI.DOUBLE], root=0)
    comm.bcast( scal, root=0)
    comm.bcast([ mat , MPI.DOUBLE], root=0) 

for proc in range(1, 3):
    if (rank == proc):
        print "Rank: ", rank, ". Array is: ", result
        print "Rank: ", rank, ". Scalar is: ", scal
        print "Rank: ", rank, ". Matrix is: ", mat

但是，我收到以下错误：

NameError: name 'mat' is not defined
    print "Rank: ", rank, ". Matrix is: ", mat

此外，在我的输出（print "Rank: ", rank, ". Scalar is: ", scal 和 print "Rank: ", rank, ". Array is: ", arr）中，我没有看到 scal 和 array 的值。我在这里错过了什么？我将非常感谢任何帮助。

Answer 1

我看到这里有两个错误：

您的变量 scal 和您的 numpy 数组 mat、arr 和 results 仅在等级 0 上定义。它们应该在所有 MPI 等级上定义。事实上，由于数据在所有行列中广播，因此必须分配变量和 Numpy 数组来存储接收到的结果。
bcast 用于 Python 对象，并被腌制（例如序列化）以便发送。 Bcast 适用于 Numpy 数组。因此，根据你的身份使用不同的调用 sending/receiving。更何况，他们还要上榜。

由于我使用的是 Python 3，因此我还更正了 print 调用。但是，由于从 future

导入 print_function，您应该不会注意到 Python 2 有任何问题

最后，我建议你看看这里的 MPI4Py 教程：http://mpi4py.scipy.org/docs/usrman/tutorial.html。我认为它们涵盖了您可以使用 MPI4Py 执行的大部分操作。

这是有效的：

from __future__ import division, print_function
from mpi4py import MPI
import numpy as np

comm = MPI.COMM_WORLD
nproc = comm.Get_size()
rank = comm.Get_rank()


scal = None
mat = np.empty([3,3], dtype='d')

arr = np.empty(5, dtype='d')
result = np.empty(5, dtype='d')


if rank==0:
    scal = 55.0
    mat[:] = np.array([[1,2,3],[4,5,6],[7,8,9]])

    arr = np.ones(5)
    result = 2*arr

comm.Bcast([ result , MPI.DOUBLE], root=0)
scal = comm.bcast(scal, root=0)
comm.Bcast([ mat , MPI.DOUBLE], root=0)

print("Rank: ", rank, ". Array is:\n", result)
print("Rank: ", rank, ". Scalar is:\n", scal)
print("Rank: ", rank, ". Matrix is:\n", mat)

mpi4py | comm.bcast 无效

mpi4py | comm.bcast does not work

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