当我加载 ggfortify 时，Autoplot 函数的行为有所不同

Question

我想为各种预测模型绘制图表。

当我加载 ggplot2 后使用自动绘图时，绘图显示如下：

autoplot(m_hw1_ff)

我还想为训练和测试数据添加拟合线。为此，我使用以下代码：

autoplot(m_hw1_ff) + 
  geom_line(aes(y=m_reg1_ff$fitted), col = "green") +
  geom_line(data=test_ts_data, aes(y=test_ts_data), col = "red")

当上面的代码是运行刚加载ggplot2后，报错如下：

Error in order(data$PANEL, data$group, data$x) : 
  argument 3 is not a vector

参考了这个问题的评论和回答后，我也加载了ggfortify包。

此后代码运行良好，并且完美绘制了训练和测试数据的拟合线。然而，之前为蓝色的阴影区域（Lo 80、Hi 80、Lo 95 和 Hi 95 的深色和浅色）已经完全变成灰色，如下图所示：

我希望阴影区域显示在第一张图中的样子。

Answer 1

您的代码有几个问题。

第一个图是使用

绘制的

forecast:::autoplot.forecast

包 forecast

中 forecast 个对象的 autplot 方法

当您加载 ggforitify 时，它被屏蔽：

ggfortify:::autoplot.forecast

这就是情节表现不同的原因。

我的建议是将预测对象转换为数据框并使用 ggplot 绘图。这将允许更高级别的定制。示例：

library(forecast)
library(ggfortify)

d.arima <- auto.arima(AirPassengers)
d.forecast <- forecast(d.arima,  h = 50)

创建用于绘图的数据框：

for_plot <- ggfortify:::fortify.forecast(d.forecast,
                                         ts.connect = TRUE)

你也可以这样做：

 for_plot <- fortify(d.forecast, 
                     ts.connect = TRUE)

加载后 ggfortify。

我就这样写了，你就明白这叫什么了。

for_plot 对象是一个数据框，不是 ggplot 喜欢的长格式。也不是适合转换为 long 的格式，但它是易于管理的：

不转换为长格式的示例（ggplot 异端方式）：

ggplot(data = for_plot) +
  geom_line(aes(x= Index, y = Data, color = "raw")) +
  geom_line(aes(x= Index, y = Fitted, color = "fitted")) +
  geom_line(aes(x= Index, y = `Point Forecast`, color = "point forecast")) +
  geom_ribbon(aes(x= Index, ymin = `Lo 80`, ymax = `Hi 80`,  fill = "80"),  alpha = 0.2) +
  geom_ribbon(aes(x= Index, ymin = `Lo 95`, ymax = `Hi 95`,  fill = "95"),  alpha = 0.2) +
  scale_fill_manual("what", values = c("blue", "dodgerblue"))+
  scale_color_manual("why", values = c("blue", "red", "green"))

ggplot 方法包括将数据分配到两个数据框，一个用于绘制色带，另一个用于绘制线条，将每个数据转换为长格式，然后进行绘制。像这样：

library(tidyverse)

for_plot_lines <- for_plot %>%
  gather(key, value, 2:4) %>%
  select(key, value, Index)

for_plot %>%
  filter(!is.na(`Point Forecast`)) %>%
  gather(Lo, ymin, c("Lo 80", "Lo 95")) %>%
  gather(Hi, ymax, c("Hi 80", "Hi 95")) -> for_plot_ribbon

ggplot(data = for_plot_lines) +
  geom_line(aes(x= Index, y = value, color = key)) +
  geom_ribbon(data = for_plot_ribbon,
              aes(x= Index, ymin = ymin, ymax = ymax, fill = Hi), alpha = 0.2)

当我加载 ggfortify 时，Autoplot 函数的行为有所不同

Autoplot function behaves differently when I load ggfortify

r

ggplot2

forecasting

ggfortify