pymc3：使用坚果
pymc3: using NUTS
我想在不同的 mcmc 方法之间进行公平比较，特别是，我想比较我的方法与 NUTS 的采样性能。但是，我认为 pymc3 中的采样函数有很多 settings/tuning 提高了采样算法的性能，超越了原来的方法。
所以，我想知道是否有人可以告诉我如何禁用这些调整。简而言之，我只想有一个简单的 NUTS 算法（通过 NUTS，我的意思是算法 6：具有双重平均的高效 No-U-Turn 采样器）
谢谢
这可能很困难——PyMC3 和 Stan（其中一些维护者编写了 NUTS 论文）都结合了新的最佳实践和改进。您可以从 github 克隆它并查看早期实现。
This commit has 一个非常接近论文中的符号的 NUTS 实现。它已被重构以使用更具描述性的变量名称以及上述改进。
我想在不同的 mcmc 方法之间进行公平比较，特别是，我想比较我的方法与 NUTS 的采样性能。但是，我认为 pymc3 中的采样函数有很多 settings/tuning 提高了采样算法的性能，超越了原来的方法。
所以，我想知道是否有人可以告诉我如何禁用这些调整。简而言之，我只想有一个简单的 NUTS 算法（通过 NUTS，我的意思是算法 6：具有双重平均的高效 No-U-Turn 采样器）
谢谢
这可能很困难——PyMC3 和 Stan（其中一些维护者编写了 NUTS 论文）都结合了新的最佳实践和改进。您可以从 github 克隆它并查看早期实现。
This commit has 一个非常接近论文中的符号的 NUTS 实现。它已被重构以使用更具描述性的变量名称以及上述改进。