"conda env export" 中未包含 pip 包

Question

我的 python 项目在 conda 虚拟环境中运行。只要该软件包可用于以这种方式安装，我就会使用 conda install 在环境中安装软件包，否则，我会使用 pip install 安装它。

为了方便其他开发者安装项目，我将conda环境使用的包列表导出到一个文件：conda env export > conda_environment_export.yml。

但是，一段时间以来，包导出不再包含 pip 安装的包。

如何使 pip 包再次出现在导出中？

几周前我的 conda 导出文件：

name: sensor_gateway
channels:
  - defaults
dependencies:
  - aiohttp=2.3.9=py36_0
  - async-timeout=2.0.0=py36hc3e01a3_0
  - certifi=2018.1.18=py36_0
  - chardet=3.0.4=py36h420ce6e_1
  - jinja2=2.10=py36h292fed1_0
  - markupsafe=1.0=py36h0e26971_1
  - multidict=3.3.2=py36h72bac45_0
  - pip=9.0.1=py36h226ae91_4
  - pymysql=0.7.11=py36hf59f3ba_0
  - python=3.6.4=h6538335_1
  - pytz=2018.3=py36_0
  - setuptools=38.4.0=py36_0
  - sqlalchemy=1.2.1=py36hfa6e2cd_0
  - vc=14=h0510ff6_3
  - vs2015_runtime=14.0.25123=3
  - wheel=0.30.0=py36h6c3ec14_1
  - wincertstore=0.2=py36h7fe50ca_0
  - yarl=0.14.2=py36h27d1bf2_0
  - pip:
    - aiohttp-jinja2==0.16.0
    - aiomysql==0.0.12
    - attrs==17.4.0
    - idna==2.6
    - idna-ssl==1.0.0
    - python-mimeparse==1.6.0
prefix: C:\ProgramData\Anaconda3\envs\sensor_gateway

conda 现在导出：

name: sensor_gateway
channels:
  - defaults
dependencies:
  - aiohttp=2.3.9=py36_0
  - async-timeout=2.0.0=py36hc3e01a3_0
  - certifi=2018.4.16=py36_0
  - chardet=3.0.4=py36h420ce6e_1
  - icc_rt=2017.0.4=h97af966_0
  - intel-openmp=2018.0.0=8
  - jinja2=2.10=py36h292fed1_0
  - markupsafe=1.0=py36h0e26971_1
  - mkl=2018.0.2=1
  - mkl_fft=1.0.1=py36h452e1ab_0
  - mkl_random=1.0.1=py36h9258bd6_0
  - multidict=3.3.2=py36h72bac45_0
  - numpy=1.14.2=py36h5c71026_1
  - pip=9.0.1=py36h226ae91_4
  - pymysql=0.7.11=py36hf59f3ba_0
  - python=3.6.4=h6538335_1
  - pytz=2018.3=py36_0
  - setuptools=38.4.0=py36_0
  - simplejson=3.14.0=py36hfa6e2cd_0
  - sqlalchemy=1.2.1=py36hfa6e2cd_0
  - vc=14=h0510ff6_3
  - vs2015_runtime=14.0.25123=3
  - wheel=0.30.0=py36h6c3ec14_1
  - wincertstore=0.2=py36h7fe50ca_0
  - yarl=0.14.2=py36h27d1bf2_0
prefix: C:\ProgramData\Anaconda3\envs\sensor_gateway

我怀疑更新 conda 的版本 (4.4.10-py36_0 --> 4.5.2-py36_0) 可能导致此项目出现此问题。在另一个项目中，我遇到了同样的问题，但我更新了 pip (9.0.1-py36h226ae91_4 --> 10.0.1-py36_0)。即使回到那里的 pip 9.0.1 之后，问题仍然存在。我的怀疑是否正确？我该怎么做才能再次解决这个问题？

更新：

目前唯一建议的答案链接到 this question，它似乎没有解决我的问题：

1.在 Windows 命令终端上，以管理员身份打开：

where pip 输出（where 作为 windows 等价于 unix/linux 上的 which 的命令：

C:\ProgramData\Anaconda3\Scripts\pip.exe
C:\Users\Sander\AppData\Local\Programs\Python\Python36\Scripts\pip.exe

pip freeze 输出：

列出我在 'normal' python 上安装的所有软件包（=默认安装的所有软件包，不在任何专用虚拟环境中）。软件包列表太长，无法包含在此处。

2。在 Windows 命令终端上，以管理员权限打开，并在执行 activate sensor_gateway:

后

where pip 输出：

C:\ProgramData\Anaconda3\envs\sensor_gateway\Scripts\pip.exe
C:\ProgramData\Anaconda3\Scripts\pip.exe
C:\Users\Sander\AppData\Local\Programs\Python\Python36\Scripts\pip.exe

pip freeze 输出：

正确列出在我的环境上使用 pip 安装的所有软件包。

所以好像我的虚拟环境启动的时候，那个环境里面安装了一个pip，而且肯定是that pip that returns的列表在要求时安装包，而不是另一个 pip 安装，因为环境中的 pip 包列表是正确的。

Answer 1

如果您使用 anaconda 安装了 pip 并使用它来安装软件包，那么 conda-env 会自动安装。

所以基本上您可以使用

导出您的环境

conda env export -n <env-name> > environment.yml

否则

请参考这个link

Answer 2

我能够通过运行在具有管理员权限的命令 window 中解决这个问题：

activate <env-name>
conda update pip

在那之后，我环境中可用包的导出再次包含使用 conda 安装的包和使用 pip 安装的包。

我怀疑我可能导致了这个包导出问题，因为我在执行包安装时遵循了 pip 之前给出的说明：

"You are using pip version 9.0.3, however version 10.0.1 is available. You should consider upgrading via the 'python -m pip install --upgrade pip' > command."

所以用 python -m pip install --upgrade pip 更新破坏了我的包导出，但 conda update pip 修复了它。

Answer 3

在撰写本文时post，由于 anaconda 读取 pip 列表时出现问题，conda export 命令仅导出通过 conda install packagename 安装的包而忽略 pip 包。

您可以尝试通过 conda install 重新安装您的软件包，看看它是否正确生成 environment.yml 文件。

Answer 4

对我来说，这只出现在使用 conda 包 pip 18 时。1_py36_0（没有尝试任何其他版本）。所以我通过

将虚拟环境中的 pip 降级到版本 10

conda install pip=10

在此之后导出再次列出 pip 包。

另请参阅 conda https://github.com/conda/conda/pull/7612 的此拉取请求，它修复了 conda 4.6.2 的问题。它还被反向移植到 conda 4.5.10。目前没有 conda 4.4.x backport.

"conda env export" 中未包含 pip 包

pip packages not included in "conda env export"

pip

anaconda

conda