Rcpp Evaluation error: subscript out of bounds

Question

我想在Rcpp代码中使用"glasso"包，cpp代码如下：

#include <RcppArmadillo.h>
 // [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
using namespace Rcpp;
// [[Rcpp::export]]
List sec(arma::mat x,double lam){
Environment gla("package:glasso");
Function gl=gla["glasso"];
double thr=1e-2;bool approx=0;
bool diag=1; bool nu=0;
List bc(5);
bc=gl(x,lam,nu,thr,thr,approx,approx,nu,nu,diag);
return(bc);}

但是当我在 R 中获取代码时，我得到了跟随错误。

set.seed(100)
x<-matrix(rnorm(50*10),ncol=10)
s<- var(x)
library(glasso)
a<-sec(s, 0.01)
"Error in sec(s, 0.01) : Evaluation error: subscript out of bounds."

我查看了"glasso"包的文档，结果列表包含5个值，所以我很困惑哪里有问题。

Answer 1

您的代码中有几个问题。最新版本的 glasso() 函数 returns 列表 7（不是 5）在我的回答中我将使用这个版本的 glasso()。要在 Rcpp 调用中将 NULL 值传递给 glasso() 函数，请使用 R_NilValue。在我的例子中，我在参数列表 glasso() 函数的末尾省略了一些值，因为我不确定你想传递什么值（看起来你使用的是这个包的旧版本）：

#include <RcppArmadillo.h>
 // [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
using namespace Rcpp;
// [[Rcpp::export]]
List sec(arma::mat x,double lam){
Environment gla("package:glasso");
Function gl=gla["glasso"];
double thr=1e-2;bool approx=0;
bool diag=1; bool nu=0;
List bc(7);
bc = gl(x, lam, R_NilValue,thr,thr,approx,diag);
return(bc);}

这是我的 R 代码：

library(Rcpp)

sourceCpp("test.cpp")

library(glasso)
set.seed(100)
x<-matrix(rnorm(50*10),ncol=10)
s<- var(x)
a<-sec(s, 0.01)


   #output
   a
    # $w
    # [,1]        [,2]         [,3]         [,4]        [,5]        [,6]
    # [1,]  0.680779447  0.33966152 -0.009663187 -0.108946142  0.07360211  0.21757108
    # [2,]  0.339661517  1.43157518 -0.042659411 -0.190859910  0.11234565  0.15097851
    #...
    # 
    # $wi
    # [,1]        [,2]        [,3]         [,4]         [,5]        [,6]
    # [1,]  2.26552621 -0.57002634  0.00000000  0.114629054 -0.159489421 -0.46727499
    # [2,] -0.58556329  1.01623488 -0.04678184  0.236972034  0.000000000 -0.03616841
    #...
    # 
    # $loglik
    # [1] -43.31512
    # 
    # $errflag
    # [1] 0
    # 
    # $approx
    # [1] FALSE
    # 
    # $del
    # [1] 0.008940439
    # 
    # $niter
    # [1] 1

Rcpp Evaluation error: subscript out of bounds

Rcpp Evaluation error: subscript out of bounds

c++

r

lasso-regression

rcpp