列中的 R 部分 gsub

Question

我有一个关于如何为 df 的第一列部分 gsub 的问题。我可以删除冒号后的所有字符串，但我想保留以 19.

开头的行的信息

df$V1:

rs1231243:G:T:0
rs483294:C:T:5098723
19:4783234:T:G
rs19873423:A:C
19:83947355:C:T
kpg897324
rs3287492:G:C

Desired output:

rs1231243
rs483294
19:4783234:T:G
rs19873423
19:83947355:C:T
kpg897324
rs3287492

code:
df$V1 <- gsub("\:.*","",df$V1)

我不知道如何有条件地 gsub 或其他方法。请指教。谢谢

Answer 1

你可以使用否定。前瞻：

gsub("^(?!19)([^:]+).*", "\1", df$V1, perl = T)

见a demo on regex101.com。

这会产生

df["V2"] <- gsub("^(?!19)([^:]+).*", "\1", df$V1, perl = T)
df
                    V1              V2
1      rs1231243:G:T:0       rs1231243
2 rs483294:C:T:5098723        rs483294
3       19:4783234:T:G  19:4783234:T:G
4       rs19873423:A:C      rs19873423
5      19:83947355:C:T 19:83947355:C:T
6            kpg897324       kpg897324
7        rs3287492:G:C       rs3287492

Answer 2

由于您想根据向量的每个值进行条件处理，您可以使用 ifelse 函数

ifelse(test, yes, no)

参数

test - 可以强制转换为逻辑模式的对象。

是 - return 测试真实元素的值。

否 - return 测试错误元素的值。

下面的代码应该

df$V1 <- ifelse(grepl("^19",df$V1), # Test
                df$V1, # yes
                gsub("\:.*","",df$V1)) # No

列中的 R 部分 gsub

R partial gsub in a column

regex

r

gsub

dataframe