MPI_ERR_TRUNCATE 通过 MPI [MPI4py] 发送复数时

Question

我正在尝试使用 Python MPI (MPI4py) 实现从单个发送方向单个接收方发送单个复数。这是代码：

from mpi4py import MPI
import numpy as np

comm = MPI.COMM_WORLD

if comm.rank == 0:

    print("I am sender")

    a = np.matrix('5+1j')

    req = [None]
    #Send message with a predefined tag, like 15, to rank 1
    req = comm.Isend([a, MPI.COMPLEX], dest=1, tag=15)

    MPI.Request.Wait(req)

    print("Sender sent:  ")
    print(a[0])

else:

    print("I am receiver")

    A = np.empty_like(np.matrix([[0]*(1) for i in range(1)]))

    print("point 1")

    #Receive message with tag 15 from rank 0
    rA = comm.Irecv(A, source=0, tag=15)

    rA.wait()

    print("Receiver received:  ")
    print(A)

请注意，上面的示例是我的目标的简化版本，即从一个发送方向多个接收方发送包含许多复杂条目的 numpy 数组（或 numpy 矩阵）。这就是为什么我在这个例子中使用非阻塞发送 Comm::Isend() 和接收 Comm::Irecv()，以及 Request::Wait()。但是一般来说，我会在 for 循环的每次迭代中有一个 Comm::Isend()，对于一个请求向量，我会有一个 Request::Waitall()，通常每个接收者都有一个。

对于上面的程序，创建的 MPI 进程只有两个，一个发送者和一个接收者。我的 MPI4py 安装也是 3.0.0。并使用 Python 2.7.14 和 Open MPI 2.1.2 的内核。

现在，程序在

处崩溃

rA.wait()

出现以下错误

mpi4py.MPI.Exception: MPI_ERR_TRUNCATE: message truncated

网上查了一下，是接收方的缓冲区不足以存储接收到的数据即复数，但我不明白为什么。

Answer 1

这是幕后发生的事情：

MPI_Isend(..., datatype=MPI_COMPLEX, ...)
MPI_Irecv(..., datatype=MPI_LONG, ...)

所以问题出在您如何初始化接收缓冲区

A = np.empty_like(np.matrix([[0]*(1) for i in range(1)]))

可能的修复是

A = np.empty(shape(1,1), dtype=complex)

或

A = np.matrix('-1-1j')

为了将A定义为复

的矩阵

MPI_ERR_TRUNCATE 通过 MPI [MPI4py] 发送复数时

MPI_ERR_TRUNCATE when sending complex number over MPI [MPI4py]

python

buffer

mpi

complex-numbers

mpi4py