将 NumPy 数组转换为 cufftComplex

Question

我正在编写一个脚本来使用基于 GPU/CUDA 的 cuFFT 库执行 FFT。 CuFFT 要求输入数据的格式必须指定为 "cufftComplex"。但是我的输入数据是 numpy.complex64 格式。我正在使用 Python C-API 将数据从 python 发送到 C。如何在两种格式之间进行转换？目前我的代码如下所示：

#include<python2.7/Python.h>
#include<numpy/arrayobject.h>
#include<cufft.h>


void compute_BP(PyObject* inputData, pyObject* OutputData, int Nfft)
{
   cuffthandle plan;
   cuFFTPlan1d(&plan, Nfft, CUFFT_C2C, CUFFT_INVERSE);
   cuFFTExecC2C(plan, inputData, OutputData, CUFFT_INVERSE);
   ...
 }

编译时出现以下错误：

Error: argument of type "PyObject *" is incompatible with parameter of type "cufftComplex".

Answer 1

借用我的回答，这是一个工作示例，说明如何使用 python 中的 ctypes 到运行中 cufft 库中的函数python 脚本，使用 numpy 数据：

$ cat mylib.cpp
#include <cufft.h>
#include <stdio.h>
#include <assert.h>
#include <cuda_runtime_api.h>
extern "C"
void fft(void *input, void *output, size_t N){

  cufftHandle plan;
  cufftComplex *d_in, *d_out;
  size_t ds = N*sizeof(cufftComplex);
  cudaMalloc((void **)&d_in,  ds);
  cudaMalloc((void **)&d_out, ds);
  cufftResult res = cufftPlan1d(&plan, N, CUFFT_C2C, 1);
  assert(res == CUFFT_SUCCESS);
  cudaMemcpy(d_in, input, ds, cudaMemcpyHostToDevice);
  res = cufftExecC2C(plan, d_in, d_out, CUFFT_FORWARD);
  assert(res == CUFFT_SUCCESS);
  cudaMemcpy(output, d_out, ds, cudaMemcpyDeviceToHost);
  printf("%s\n", cudaGetErrorString(cudaGetLastError()));
  printf("from shared object:\n");
  for (int i = 0; i < N; i++)
    printf("%.1f + j%.1f, ", ((cufftComplex *)output)[i].x, ((cufftComplex *)output)[i].y);
  printf("\n");
}

$ cat t8.py
import ctypes
import os
import sys
import numpy as np

mylib = ctypes.cdll.LoadLibrary('libmylib.so')

N = 4
mydata = np.ones((N), dtype = np.complex64)
myresult = np.zeros((N), dtype = np.complex64)
mylib.fft(ctypes.c_void_p(mydata.ctypes.data), ctypes.c_void_p(myresult.ctypes.data), ctypes.c_size_t(N))
print(myresult)

$ g++ -fPIC -I/usr/local/cuda/include --shared mylib.cpp -L/usr/local/cuda/lib64 -lcufft -lcudart -o libmylib.so
$ LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:`pwd` python t8.py
no error
from shared object:
4.0 + j0.0, 0.0 + j0.0, 0.0 + j0.0, 0.0 + j0.0,
[4.+0.j 0.+0.j 0.+0.j 0.+0.j]
$

将 NumPy 数组转换为 cufftComplex

Converting a NumPy Array to cufftComplex

python

numpy

cuda

cufft