R 网状无法找到已安装的 python 库

Question

我正在尝试在 R 中使用 Reticulate，但在安装软件包时遇到了问题，特别是 psycopg2，但我也尝试过安装 twisted，但结果相同。

我在 R 中加载 reticulate 后，我仔细检查以确保我的包已安装：

> conda_install(envname = "r-reticulate", packages="psycopg2")
Solving environment: ...working... done

# All requested packages already installed.

看起来不错。所以我将我的 condaenv 设置为 r-reticulate 只是为了双重确定。文档说我不应该这样做，但它不应该伤害：

> use_condaenv( "r-reticulate")

然后我尝试导入 psycopg2:

> psycopg2 <- import('psycopg2')
Error in py_module_import(module, convert = convert) : 
  ImportError: No module named psycopg2

如果我以同样的方式安装 twisted，我会得到同样的错误：

> twisted <- import('twisted')
Error in py_module_import(module, convert = convert) : 
  ImportError: No module named twisted

那么，我做错了什么？

下面是 conda_list 和 py_config 的输出...我期待 py_config 向我显示我 [=19] 中 python exe 的路径=] 环境。但是我没有什么可以与之比较的，所以我的期望可能是错误的。

> conda_list()
          name                                                                              python
1     Anaconda                     C:\Users\jal\AppData\Local\Continuum\Anaconda\python.exe
2 r-reticulate C:\Users\jal\AppData\Local\Continuum\Anaconda\envs\r-reticulate\python.exe

> py_config()
python:         C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda\python.exe
libpython:      C:/Users/jal/AppData/Local/CONTIN~1/Anaconda/python27.dll
pythonhome:     C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda
version:        2.7.15 |Anaconda custom (64-bit)| (default, May  1 2018, 18:37:09) [MSC v.1500 64 bit (AMD64)]
Architecture:   64bit
numpy:          C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda\lib\site-packages\numpy
numpy_version:  1.14.3
pandas:         C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda\lib\site-packages\pandas

python versions found: 
 C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda\python.exe
 C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\ANACON~1\python.exe

Answer 1

一时兴起，我下载并安装了最新的 RStudio 桌面 (1.2.701)，并从 1.1.442 升级。这似乎解决了我的问题。包加载，我现在看到当我运行 py_config 时，我看到了反映我的环境选择的路径，正如我所期望的那样。

> py_config()
python:         C:\Users\jal\AppData\Local\Continuum\Anaconda\envs\r-reticulate\python.exe
libpython:      C:/Users/jal/AppData/Local/Continuum/Anaconda/envs/r-reticulate/python36.dll
pythonhome:     C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda\envs\R-RETI~1
version:        3.6.5 |Anaconda, Inc.| (default, Mar 29 2018, 13:32:41) [MSC v.1900 64 bit (AMD64)]
Architecture:   64bit
numpy:          C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda\envs\R-RETI~1\lib\site-packages\numpy
numpy_version:  1.14.3
psycopg2:       C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda\envs\R-RETI~1\lib\site-packages\psycopg2

python versions found: 
 C:\Users\jal\AppData\Local\Continuum\Anaconda\envs\r-reticulate\python.exe
 C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda\python.exe
 C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\ANACON~1\python.exe

Answer 2

我通过以下方式解决了我的问题：

关闭 RStudio。
打开终端并激活你想要的环境。
运行 RStudio $ open -na Rstudio

现在你有了你的 anac

Answer 3

我在 RStudio 中按照这种方式解决了我的问题：

py_config() No non-system installation of Python could be found. Would you like to download and install Miniconda? Miniconda is an open source environment management system for Python. See https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html for more details.

您要安装 Miniconda 吗？ [Y/n]: Y

正在下载“https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Windows-x86_64.exe”... 尝试 URL 'https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Windows-x86_64.exe' 内容类型 'application/octet-stream' 长度 57256056 字节 (54.6 MB) 下载 54.6 MB
正在安装 Miniconda -- 请稍等...

R 网状无法找到已安装的 python 库

R reticulate unable to find installed python library

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reticulate