如何在 R 中修复 "failed to load cairo DLL"？

Question

我运行收到此将停止执行的警告消息。

Saving 8.04 x 5.67 in image
Warning messages:
1: In dev(file = filename, width = dim[1], height = dim[2], ...) :
  unable to load shared object '/usr/local/Cellar/r/3.5.0_1/lib/R/library/grDevices/libs//cairo.so':

  dlopen(/usr/local/Cellar/r/3.5.0_1/lib/R/library/grDevices/libs//cairo.so, 6): image not found
2: In dev(file = filename, width = dim[1], height = dim[2], ...) :
  failed to load cairo DLL

这是为我生成警告的代码

library(tidyverse)
library(cowplot)

d <- sample_n(diamonds, 50)
g <- ggplot(d, aes(carat, price)) + geom_point()
gg <- list(g,g,g)

plot_grid(plotlist = gg, nrow=1) %>% 
  cowplot::ggsave(filename = paste0("~/Desktop/", paste0("testing", ".svg")), device = cairo_ps)

我该如何解决这个错误？

P.s。我是新手

编辑：这是我的会话信息。我不确定这是否有帮助。为了以防万一，我已经包含了它。

sessionInfo()

R version 3.5.0 (2018-04-23)
Platform: x86_64-apple-darwin17.6.0 (64-bit)
Running under: macOS High Sierra 10.13.5

Matrix products: default
BLAS: /System/Library/Frameworks/Accelerate.framework/Versions/A/Frameworks/vecLib.framework/Versions/A/libBLAS.dylib
LAPACK: /System/Library/Frameworks/Accelerate.framework/Versions/A/Frameworks/vecLib.framework/Versions/A/libLAPACK.dylib

locale:
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8

attached base packages:
[1] parallel  stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
 [1] cowplot_0.9.2     forcats_0.3.0     stringr_1.3.1     dplyr_0.7.5      
 [5] purrr_0.2.5       readr_1.1.1       tidyr_0.8.1       tibble_1.4.2     
 [9] ggplot2_2.2.1     tidyverse_1.2.1   doParallel_1.0.11 iterators_1.0.9  
[13] foreach_1.4.4     lmerTest_3.0-1    lme4_1.1-17       Matrix_1.2-14    

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] tidyselect_0.2.4  reshape2_1.4.3    splines_3.5.0     haven_1.1.1      
 [5] lattice_0.20-35   argparse_1.1.1    colorspace_1.3-2  getopt_1.20.2    
 [9] yaml_2.1.19       rlang_0.2.1       nloptr_1.0.4      pillar_1.2.3     
[13] foreign_0.8-70    glue_1.2.0        readxl_1.1.0      modelr_0.1.2     
[17] bindrcpp_0.2.2    bindr_0.1.1       plyr_1.8.4        cellranger_1.1.0 
[21] munsell_0.4.3     findpython_1.0.3  gtable_0.2.0      rvest_0.3.2      
[25] codetools_0.2-15  psych_1.8.4       labeling_0.3      broom_0.4.4      
[29] proto_1.0.0       Rcpp_0.12.17      scales_0.5.0      jsonlite_1.5     
[33] mnormt_1.5-5      hms_0.4.2         stringi_1.2.2     numDeriv_2016.8-1
[37] grid_3.5.0        cli_1.0.0         tools_3.5.0       magrittr_1.5     
[41] lazyeval_0.2.1    crayon_1.3.4      pkgconfig_2.0.1   MASS_7.3-49      
[45] xml2_1.2.0        lubridate_1.7.4   rstudioapi_0.7    assertthat_0.2.0 
[49] minqa_1.2.4       httr_1.3.1        R6_2.2.2          nlme_3.1-137     
[53] compiler_3.5.0

Answer 1

我只有一台 Windows 机器可以提供，但以下方法可以同时保存你的 cowplot 的 .svg 和 .eps（在安装包 svglite 之后） ):

# install.packages(svglite)
library(tidyverse)
library(cowplot)

d <- sample_n(diamonds, 50)
g <- ggplot(d, aes(carat, price)) + geom_point()
gg <- list(g,g,g)

plot_grid(plotlist = gg, nrow=1)
ggsave(filename = "testing.svg")
ggsave(filename = "testing.eps")

您当然可以将文件名修改为 "~/Desktop/testing.svg" 之类的名称，具体取决于您要保护情节的位置。请注意，ggsave 默认保存最后一个活动图，您指定的文件名的结尾应自动触发正确的设备。

Answer 2

R 的 Homebrew 版本不再支持 cairo (more info here)，因此基础中的 svg()、cairo_pdf() 和 cairo_ps() 等图形设备如果您通过 brew install r 安装 R，R 将无法工作。您必须使用其他图形设备（例如，png、jpeg、pdf）。如果您需要 SVG 输出，ggsave() 需要 svglite 包并使用 svglite::svglite() 将绘图保存到 SVG 文件。

如果你确实想使用 Homebrew 安装 R，我推荐 brew cask install r。

Answer 3

我有同样的问题，我使用 MacOS。根据 CRAN，我发现它与 XQuartz 相关 "，因为它不再是 OS X" 的一部分。我安装了 XQuartz，基本上所有 Cairo 相关的问题都得到了解决。

如何在 R 中修复 "failed to load cairo DLL"？

How to fix "failed to load cairo DLL" in R?

r

cairo