如何在 R 上绘制具有不同边缘类型的网络？

Question

我想绘制一个定向加权网络，我可以在其中显示参与者之间的股票交易。我不确定我们是否可以在 igraph R 包的边缘列表中添加第三列（"TYPE"）。如果是这样，我们可以根据购买的库存区分边缘吗？例如苹果：蓝边，google：红边，辉瑞：橙边。

边锋

FROM TO VALUE TYPE
A    B  100   Apple
B    C  50    Pfizer
C    D  80    Apple
A    E  70    Google

    require(igraph)
test<-as.matrix(edge_list_test)
test[,1]<-as.character(test[,1])
test[,2]<-as.character(test[,2])
test[,4]<-as.character(test[,4])
g<-graph.edgelist(test[,1:2], directed=TRUE)
V(g)$size=degree(g)
E(g)$type=as.character(test[,4])
E(g)$weight=as.numeric(test[,3])
    plot(g, layout=layout.fruchterman.reingold, edge.width=E(g)$weight, vertex.color=V(g)$type, vertex.label.dist=0.5)][1]][1]

为什么根据"TYPE"，边缘是灰色的，看不到边缘的不同颜色？

Answer 1

当我运行你提供的代码时，我得到了大得离谱的箭头，所以我会调整 edge.width。您的绘图语句中没有任何内容设置边缘颜色。您需要使用 edge.color 参数明确地执行此操作。

CR = rainbow(length(unique(edge_list_test$TYPE)))
plot(g, layout=layout.fruchterman.reingold, 
    edge.width=E(g)$weight/15, vertex.color=V(g)$type, 
    vertex.label.dist=0.5, edge.color=CR[edge_list_test$TYPE])
legend("topleft", legend=levels(edge_list_test$TYPE), lwd=2, col=CR)

我使用 edge_list_test$TYPE 到 select 边缘颜色而不是 E(g)$type 因为 edge_list_test$TYPE 是一个因素而 E(g)$type 只是一个字符串。

如何在 R 上绘制具有不同边缘类型的网络？

how to plot network with different edge types on R?

r

igraph

graph-visualization