删除列中具有某些特定值的行

Question

我想删除包含 chr1_ _random 的行，然后根据 chr 和 start 列对我的数据进行排序：

数据：

Coordinates                                         chr     start       end                                              
chr1_gl000191_random:25220-31247 chr1_gl000191_random     25220     31247                                 
chr1_gl000191_random:28291-31301 chr1_gl000192_random     28291     31301  
chr1:100015775-100016525                         chr1 100015775 100016525       
chr1:10001650-10004925                           chr1  10001650  10004925

输出：

Coordinates                                         chr     start       end                                               
chr1:10001650-10004925                           chr1  10001650  10004925
chr1:100015775-100016525                         chr1 100015775 100016525

感谢您提前提出任何建议！

Answer 1

要删除包含 chr1_ _random 的行，请使用

data <- data[grepl("chr1\_.*\_random", data$chr) == FALSE,]

然后用于排序

attach(data)
data = data[order(start, end),]
detach(data)