从 R 到 LaTeX 的格式化科学名称（使用 Sweave 或 knitr）

Question

我正在包 taxlist 中实现一个函数 print_name。例如，我可以为 markdown 格式化名称：

library(taxlist)
data(Easplist)
print_name(Easplist, 206, style="markdown")

此时控制台输出为：

[1] "*Cyperus papyrus* L."

例如，我可以使用此命令在 markdown 文档的内容中提及一个物种 `r I(print_name(Easplist, 206, style="markdown"))`，其中学名显示为斜体，作者姓名不显示。

我想实现一个选项（即 style="latex"）检索为 LaTeX 格式化的字符串，可以通过 \Sexpr{print_name(Easplist, 206, style="latex")} 之类的东西插入（这个例子只是一个假设的例子）。输出应该是 \textit{Cyperus papyrus} L. 但我所有的尝试都失败了，因为反斜杠是 R 字符串中的一个 scape。

有没有办法正确完成这个任务？

注意： 该功能目前未在 CRAN 版本的软件包中实现，因此要重现示例，请使用 GitHub 的最新版本：

devtools::install_github("kamapu/taxlist")

Answer 1

我想象你正在做的是这样的：

<<example, echo=FALSE>>=
library(taxlist)
data(Easplist)
\Sexpr{print_name(Easplist, 206, style="markdown")}
@

只需将 \Sexpr{} 移动到块外。

<<example, echo=FALSE>>=
library(taxlist)
data(Easplist)
@

\Sexpr{print_name(Easplist, 206, style="markdown")}

那会输出你想要的。

编辑：

如果您尝试将 "latex" 作为输出的样式选项，那么当它在 latex 之外输出时应该如下所示：

library(taxlist)
data(Easplist)
print_name(Easplist, 206, style="latex")
[1] "\textit{Cyperus papyrus} L."

将“\”转义转义。我没有将它合并到你的函数中，但这里有一个例子：

<<>>=
example_text <- "Cyperus papyrus L."
example_text <- strsplit(example_text, split = " ")
test1 <- paste0("\textit{", example_text[[1]][1], " ", example_text[[1]][2], "}", 
            " ", example_text[[1]][3])
@

\Sexpr{test1} is a paper reed.

输出在呈现的 pdf 中看起来像这样。

从 R 到 LaTeX 的格式化科学名称（使用 Sweave 或 knitr）

Formatted scientific names from R to LaTeX (using Sweave or knitr)

r

latex

knitr

taxonomy

sweave