如何在 Jenkins 上激活 conda 环境

Question

我看到了 this 问题，但我运行正在使用 RHEL 7.3，而不是 Windows。

使用这个简单的 Jenkins shell 脚本：

#!/bin/bash
echo $PATH
echo $HOME
source /app/local/anaconda3/bin/activate py35_myenv

我遇到了这个失败：

$ /bin/bash /tmp/jenkins5945453203311093000.sh
/sbin:/usr/sbin:/bin:/usr/bin:/opt/teradata/client/15.10/bin:/app/local/anaconda3/bin:/opt/teradata/client/15.10/bin:/app/local/anaconda3/bin
/home/jenkins
/tmp/jenkins5945453203311093000.sh: line 4: /app/local/anaconda3/bin/activate: Permission denied

我尝试 chmod 将 /app/local/anaconda3/bin/activate 文件设置为 664（最初是 660），但这没有帮助。也试过chmod -R o+rx /app/local/anaconda3/envs/py35_myenv（那里下的可执行文件原来是770个，现在是775个）。那也没有帮助。我尝试这样做的原因是因为我收到 "Permission denied" 投诉，并且这台机器上的 jenkins 用户不属于这些 Anaconda 文件所在的组。

根据建议 here，我尝试将 #!/bin/bash 添加到我的 Jenkins 脚本的开头，但这没有帮助。

普通的非 Jenkins 用户可以很好地激活这个 conda 环境。我正在尝试让 Jenkins 运行自动化脚本脱离此环境，但我无法在 Jenkins 作业中激活它。

编辑：如果我不提供 activate 的完整路径，我会收到 "activate: No such file or directory" 投诉。

编辑：activate 被赋予 664（不可执行）的 chmod 的原因在上说明。 activate 必须是不可执行的并且运行通过 source 以便它可以对环境进行更改。

詹金斯版本：2.129-1.1

Answer 1

chmod664没有给你执行权限。您可以在 chmod 命令中明确指定要授予或撤销哪些权限。它更具可读性。尝试将您的脚本更改为以下内容：

#!/bin/bash
echo $PATH
echo $HOME
/app/local/anaconda3/bin/activate py35_myenv
chmod ug+x /app/local/anaconda3/bin/activate

您可以使用 https://chmodcommand.com 来验证命令是否符合您的预期。

此外，如果 jenkins 用户无权访问脚本的父文件夹之一，则可能会出现问题。也尝试为父文件夹设置相同的权限。以下命令来自您在评论中的代码片段：

sudo find . -perm 770 -exec chmod o+rx {}; \
sudo find . -perm 750 -exec chmod o+rx {}; \
sudo find . -perm 660 -exec chmod o+r {}; \
sudo find . -perm 640 -exec chmod o+r {}

Answer 2

在 Jenkins 的 Executed shell 中添加以下行，因为 bash shell 不支持 conda init.

export PATH=/path/to/anaconda3/bin:$PATH # modify this path 
eval "$(conda shell.bash hook)"
conda activate your_env # change your_env based on your env name

Answer 3

隐藏不需要的输出：

steps {
            sh """
                #!/usr/bin/env bash
                set +x
                source /opt/conda/etc/profile.d/conda.sh
                conda activate env-p38
                echo $PATH
                set -x
                """
  }

如何在 Jenkins 上激活 conda 环境

How to activate a conda environment on Jenkins

jenkins

conda