Scikit-learn - ValueError: Input contains NaN, infinity or a value too large for dtype('float32') with Random Forest

Scikit-learn - ValueError: Input contains NaN, infinity or a value too large for dtype('float32') with Random Forest

首先,我查看了有关此错误的不同帖子,其中 none 可以解决我的问题。

所以我正在使用 RandomForest,我能够生成森林并进行预测,但有时在生成森林的过程中,我会收到以下错误。

ValueError: Input contains NaN, infinity or a value too large for dtype('float32').

同一数据集出现此错误。有时数据集会在训练期间产生错误,而大多数时候不会。错误有时出现在训练开始时,有时出现在训练过程中。

这是我的代码:

import pandas as pd
from sklearn import ensemble
import numpy as np

def azureml_main(dataframe1 = None, dataframe2 = None):

    # Execution logic goes here

    Input = dataframe1.values[:,:]
    InputData = Input[:,:15]
    InputTarget = Input[:,16:]

    limitTrain = 2175

    clf = ensemble.RandomForestClassifier(n_estimators = 10000, n_jobs = 4 );

    features=np.empty([len(InputData),10])
    j=0
    for i in range (0,14):
        if (i == 1 or i == 4 or i == 5 or i == 6 or i == 8 or i == 9 or  i == 10 or i == 11 or i == 13 or i == 14):
            features[:,j] = (InputData[:, i])
            j += 1     
        
    clf.fit(features[:limitTrain,:],np.asarray(InputTarget[:limitTrain,1],dtype = np.float32))

    res = clf.predict_proba(features[limitTrain+1:,:])

    listreu = np.empty([len(res),5])
    for i in range(len(res)):
        if(res[i,0] > 0.5):
            listreu[i,4] = 0;
        elif(res[i,1] > 0.5):
            listreu[i,4] = 1;
        elif(res[i,2] > 0.5):
            listreu[i,4] = 2;
        else:
            listreu[i,4] = 3;
    

    listreu[:,0] = features[limitTrain+1:,0]
    listreu[:,1] = InputData[limitTrain+1:,2]
    listreu[:,2] = InputData[limitTrain+1:,3]
    listreu[:,3] = features[limitTrain+1:,1]



    # Return value must be of a sequence of pandas.DataFrame
    return pd.DataFrame(listreu),

我在本地和 Azure ML Studio 上 运行 我的代码,两种情况下都会出现错误。

我确定这不是我的数据集造成的,因为大多数时候我没有收到错误,而是我自己从不同的输入生成数据集。

这是一个part of the dataset I use

编辑: 我可能发现我的 0 值不是真正的 0 值。这些值就像

3.0x10^-314

尝试使用 float64 而不是 float32。 编辑:

  • 向我们展示执行此操作的数据集

我假设在你数据框的某处你有时有 nan 值。

这些可以简单地使用

删除
dataframe1 = dataframe1.dropna()

但是,使用这种方法您可能会丢失一些有价值的训练数据,因此可能值得研究 .fillna() 或 sklearn.preprocessing.Imputer 以增加 df 中 nan 单元的一些值。

在没有看到 dataframe1 的来源的情况下,很难给出完整/完整的答案,但可能正在进行某种训练、测试拆分,导致传递的数据帧有时仅具有 nan 值.

前段时间,当我在参数中使用 CPU 的明确数量时,例如您的 n_jobs = 4,我遇到了不稳定的错误。尝试完全不使用 n_jobs 或使用 n_jobs = -1 进行自动 CPU 计数检测。可能会有帮助。

自从我改正了编辑的问题后,我再没有错误了。我只是将 3.0x10^-314 值替换为零。