没有名为 'dolfin' 的模块使用 Spyder

Question

我这辈子都做不到 dolfin运行 Spyder。起初我就是这么想的。我设法以某种方式获得了它运行，但不是以一种方便的方式。情况是这样的：

错误

conda activate fenics, spyder, from dolfin import *: No module named 'dolfin'.

有效方法

conda activate fenics, python, from dolfin import *: 工作在第一位。
conda activate fenics、ipython、from dolfin import *：经过一些调整后工作。
conda activate fenics、spyder、from dolfin import *：经过一些调整后工作。

到目前为止我做了什么

我使用从 conda 下载的建议安装了 anaconda。

运行 conda create -n fenics -c conda-forge fenics、conda install fenics 和 conda activate fenics 安装并激活 fenics 环境。

然后启动 python 并执行 from dolfin import * 工作。 :)

运行 ipython 中的相同命令不起作用。使用 conda list 我发现

    ...
    hdf5
    hypre
    icu
    isl
    jedi
    ...

列表中没有 ipython，which 与 python 和 ipthon 产生

    /home/hannes/anaconda3/envs/fenics/bin/python
    /home/hannes/anaconda3/bin/python

因此，conda install ipython、ipython 和 from dolfin import * 也有效！ :)

运行 spyder 和 from dolfin import * 抛出与之前 ipython 相同的错误：No module named 'dolfin'。也许 spyder 在 fenics 的环境中也不可用？ conda list ... 不，不在那里。现在开始有趣的部分...... :(。 conda install spyder 和 which spyder 产生

    /home/hannes/anaconda3/envs/fenics/bin/spyder

但是，运行 spyder 抛出错误

    libGL error: unable to load driver: r600_dri.so
    libGL error: driver pointer missing
    libGL error: failed to load driver: r600
    libGL error: unable to load driver: r600_dri.so
    libGL error: driver pointer missing
    libGL error: failed to load driver: r600
    libGL error: unable to load driver: swrast_dri.so
    libGL error: failed to load driver: swrast
    Segmentation fault (core dumped)

这似乎是一些 opengl 问题。来自 github issue 6968、conda install pyopengl 的解决方案没有帮助 :(；仍然是相同的 libGL 错误。所以，conda uninstall spyder，spyder至少还给了我spyder。

目前我最好的线索

我尝试通过添加

将模块添加到 PYTHONPATH

    export PYTHONPATH="$PYTHONPATH:/home/hannes/anaconda3/envs/fenics/lib/python3.6/site-packages/"

到.bashrc和运行一个不在fenics环境中的Spyder。没有成功，虽然我不确定我是否正确执行了这一步。为什么，conda activate fenics、spyder和sys.path吐槽：

    /home/hannes/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/spyder
    /home/hannes/anaconda3/lib/python36.zip
    /home/hannes/anaconda3/lib/python3.6
    /home/hannes/anaconda3/lib/python3.6/lib-dynload
    /home/hannes/.local/lib/python3.6/site-packages
    /home/hannes/anaconda3/lib/python3.6/site-packages
    /home/hannes/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/IPython/extensions
    /home/hannes/.ipython

由于那没有用，我在运行 conda activate fenics、ipython

之后得到了 from dolfin import *

    import sys
    sys.path.append('/home/hannes/anaconda3/envs/fenics/lib/python3.6/site-packages')

因为这只是一个临时解决方法（我每次启动 Spyder 时都必须添加它）我对永久修复感兴趣。

如果有任何帮助，我将不胜感激 :)。

汉内斯

Answer 1

(Spyder maintainer here) 由于 Spyder 3.3.1（将在几天内发布），解决方案是以下：

激活您的环境
使用以下命令安装 spyder-kernels 软件包：

conda install spyder-kernels=0.*
还有运行那里（在系统终端）

python -c "import sys; print(sys.executable)"

并复制该命令返回的路径。
停用您的环境并从您的根目录或基础目录启动 Spyder。
转到

Tools > Preferences > Python Interpreter > Use the following interpreter

并粘贴您在第 3 步中获得的路径。
启动一个新的 IPython 控制台和运行

from dolfin import *

现在应该可以了。

没有名为 'dolfin' 的模块使用 Spyder

No module named 'dolfin' using Spyder

ipython

spyder

anaconda

fenics