lapacke.h 在 CentOS 5 中

Question

我正在尝试创建一个使用 BLAS 和 LAPACK C 扩展的 Python 轮子。在 Ubuntu 下编译此类包需要以下系统包：

libopenblas-dev：（打开）BLAS 开发库
liblapack-dev：LAPACK 开发库
liblapacke-dev：C headers for LAPACK

这很好用，但现在我需要在 CentOS 5 下重复这个过程。原因是我正在尝试创建一个 manylinux 轮子，而 a recommended way 似乎正在使用旧的 CentOS 工具链，以保证它可以在不同的 linux 发行版下工作。

问题是，虽然 libopenblas-dev 和 liblapack-dev 在 CentOS 5 中是等价的（openblas-devel 和 lapack-devel），但 [=13= 没有等价的软件包].考虑到这些软件包中提供的 LAPACK 版本非常旧（3.0），似乎不支持 lapacke，这是有道理的。但正因为如此，我无法编译我的软件，因为 gcc 抱怨缺少 lapacke.h headers.

我尝试过的事情：

正在手动下载和编译较新的 LAPACK 版本（3.8.0 和 3.6.0）。我收到编译错误。
直接将 lapacke.h header 从上述 LAPACK 版本之一复制到 /usr/include。没用，可能是因为LAPACK版本不同。
在 official instructions 之后添加英特尔 MKL 存储库，并用 MKL 替换 BLAS/LAPACK。不幸的是 CentOS 5 在 yum-config-manager 中没有包含 --add-repo 选项，所以我在这里有点不知所措。

Answer 1

CentOS 5.0 不支持lapacke，所以C 接口不可用，但你仍然可以通过调用fortran 符号来实现。

首先，为 BLAS 和 LAPACK 安装 CentOS 软件包

yum install -y blas-devel lapack-devel

并将这些库添加到链接器路径

export LD_LIBRARY_PATH="${LD_LIBRARY_PATH}:/usr/lib64"

现在您应该可以通过导入 Fortran 符号在 C/C++ 扩展代码中使用 BLAS 和 LAPACK 函数。例如，要在 C++ 源代码中使用 LAPACK 函数 dpttrs，您需要将其声明为外部 C 符号

extern "C" {
    void dpttrs_(lapack_int* n, lapack_int* nrhs, const double* d, const double* e, 
                 double* b, lapack_int* ldb, lapack_int *info );
}

然后调用dpttrs_函数就可以正常使用了

最后，在捆绑 python 软件包时，确保包含 blas 和 lapack 库以及 headers。例如，当使用 cffi 时，您应该按照以下模式配置源

ffi.set_source(
    'YOUR MODULE NAME',
    "BASE SOURCES",
    sources=sources,
    source_extension='.cpp',
    libraries=['blas', 'lapack'],
    include_dirs=['/usr/include']
)

lapacke.h 在 CentOS 5 中

lapacke.h in CentOS 5

centos5

lapack

lapacke

python-wheel

python-manylinux