python 曲线拟合结果汇总

Question

抱歉，我对 python 还是很陌生，希望有人能帮我解决曲线拟合问题...

我有一个 MxN 数据帧 "data"，其中 M 是样本数，N 是变量数 (10)。我有一个 Mx1 因变量 "Fractions"，它是对应于每个样本的介于 0 和 1 之间的分数。

我知道如何轻松运行自变量 N 和因变量分数之间的多元线性回归，但是，我将回归包装在 S 形回归中以将响应保持在 0 和 1 之间。

我能够像这样执行...

def sigmoid(x,b0,b1,b2,b3,b4,b5,b6,b7,b8,b9,b10):
    y = 1 / (1 + np.exp(- (b0 + b1*x[:,0] + b2*x[:,1] + b3*x[:,2] + b4*x[:,3] + b5*x[:,4] +
                       b6 * x[:,5] + b7*x[:,6] + b8*x[:,7] + b9*x[:,8] + b10*x[:,9])))
    return y

popt, pcov = curve_fit(sigmoid,data,fractions)

'''use coefficients from curve_fit to estimate new fraction from new 1xN data'''
newFraction = sigmoid(newData, *popt)

但是，我想为特征选择实现某种逐步多元回归，最好基于 AIC。我使用 python...

找到了以下这些方法

http://scikit-learn.org/stable/modules/generated/sklearn.feature_selection.RFE.html https://planspace.org/20150423-forward_selection_with_statsmodels/ https://datascience.stackexchange.com/questions/24405/how-to-do-stepwise-regression-using-sklearn/24447#24447

但是所有这些方法都依赖于使用涉及 .fit() 方法的回归。有没有办法使用任何 .fit() 方法（如 statsmodels 或 lmfit）来实现上述模型？我也研究过 Lasso 类型的方法，但是，再次无法弄清楚如何实现我的功能。

Answer 1

我认为你应该能够用 lmfit 做这样的事情（不完整，因为你的例子不完整）：

from lmfit import Model
def sigmoid(x,b0,b1,b2,b3,b4,b5,b6,b7,b8,b9,b10):
    y = 1 / (1 + np.exp(- (b0 + b1*x[:,0] + b2*x[:,1] + b3*x[:,2] + b4*x[:,3] + b5*x[:,4] +
                       b6 * x[:,5] + b7*x[:,6] + b8*x[:,7] + b9*x[:,8] + b10*x[:,9])))
    return y

smodel = Model(sigmoid)
params = smodel.make_params(b0=1, b1=0, b2=0.1, b3=0.01, b4=0.01, b5=0.01, 
                            b6=0.01, b7=0.01, b8=0.01, b9=0.01, b10=0.01)

result = smodel.fit(data, params, x=x)

这将通过最小化卡方来拟合。

我相信对于任何特定拟合（将有固定数量的数据点和固定数量的变量），最小化卡方也会最小化 AIC（因为卡方是正定的，并且AIC = 2*Nvarys + Ndata * log(chi_square / Ndata)

python 曲线拟合结果汇总

python curve fitting with results summary

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