使用多个变量级别重塑 R 中的数据 - "aggregate function missing" 警告

Reshaping data in R with multiple variable levels - "aggregate function missing" warning

我正在尝试在 reshape2 中使用 dcast 将数据框从长格式转换为宽格式。数据是医院就诊日期和诊断列表。 (Dx.num 列出单次就诊的诊断顺序。如果是同一位患者 returns,则此变量重新开始,新就诊的初步诊断从 1 开始。)我希望有一个每个人的行数 (id)。数据结构为:

id  visit.date  visit.id    bill.num    dx.code FY  Dx.num  
1   1/2/12      203         1234        409    2012  1      
1   3/4/12      506         4567        512    2013  1      
2   5/6/18      222         3452        488    2018  1      
2   5/6/18      222         3452        122    2018  2      
3   2/9/14      567         6798        923    2014  1 

我想我最终会得到这样的专栏:

id, date_visit1, date_visit2, visit.id_visit1, visit.id_visit2,  bill.num_visit1, bill.num_visit2, dx.code_visit1_dx1, dx.code_visit1_dx2   dx.code_visit2_dx1, FY_visit1_dx1, FY_visit1_dx2, FY_visit2_dx1

最初,我尝试创建一个像这样的 visit_dx 列:

**visit.dx** 
v1dx1 (visit 1, dx 1)
v2dx1 (visit 2, dx 1)
v1dx1 (...)
v1dx2
v1dx1

并使用了以下代码,从 DF 中省略了 "Dx.num",因为它在 "visit.dx" 中已说明:

    wide <-
    dcast(
    setDT(long),
    id + visit.date + visit.id + bill.num ~ visit.dx,
    value.var = c(
      "dx.code",
      "FY"
    )
  )

当我 运行 这样做时,我收到警告 "Aggregate function missing, defaulting to 'length'" 和充满 0 和 1 的新数据帧。但是,数据框中没有重复的行。我开始认为我应该以完全不同的方式来处理这件事。

如有任何帮助,我们将不胜感激。

data.table 包扩展了 dcast rowid and allowing multiple value.var,所以...

library(data.table)
dcast(setDT(DF), id ~ rowid(id), value.var=setdiff(names(DF), "id"))

   id visit.date_1 visit.date_2 visit.id_1 visit.id_2 bill.num_1 bill.num_2 dx.code_1 dx.code_2 FY_1 FY_2 Dx.num_1 Dx.num_2
1:  1       1/2/12       3/4/12        203        506       1234       4567       409       512 2012 2013        1        1
2:  2       5/6/18       5/6/18        222        222       3452       3452       488       122 2018 2018        1        2
3:  3       2/9/14         <NA>        567         NA       6798         NA       923        NA 2014   NA        1       NA