从 paleoView 导入 R 中的 netcdf 时只有正纬度和经度可能是错误的投影

Only positive latitude and longitude when importing netcdf in R from paleoView probably wrong projection

我使用paleoview软件从过去的气候中下载了一些变量,包括15000BP-10000BP的平均温度(我可以根据要求上传文件,但至少是一个GB)。

主要问题是当我读取栅格时,它只包含正纬度和正经度。我从文章中知道它有一个 2.5*2.5 的分辨率。

使用光栅

我加载了光栅和 ncdf4 库以使用光栅读取它

library(raster)
library(ncdf4)

当我使用以下代码阅读它时

r <- raster("mean_temperature-15000BP-10000BP.nc",  varname = "14000BP-13000BP/13300BP")

我得到以下信息

r
class       : RasterLayer 
band        : 1  (of  12  bands)
dimensions  : 72, 144, 10368  (nrow, ncol, ncell)
resolution  : 1, 1  (x, y)
extent      : 0.5, 144.5, 0.5, 72.5  (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : +proj=longlat +datum=WGS84 +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0 
names       : Mean.Temperature 
z-value     : 1 
zvar        : 14000BP-13000BP/13300BP 

如你所见,范围只是正数,但我知道它有整个世界的数据,当我绘制地图时,我得到以下图像:

plot(r)

这清楚地显示了极圈温度极低且南极洲比北极大的预期模式。

显然 +proj=longlat +datum=WGS84 +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0 在这里是错误的,我认为如果我弄清楚实际的 coord 是什么。 ref. 我可以重新投影它并获得正确格式的光栅

使用 ncdf4

我尝试使用 ncdf4 包来尝试从图层中获取更多信息,这就是我所做的:

nc <- nc_open("mean_temperature-15000BP-10000BP.nc")

在使用 nc_open 函数读取图层后,我看到了变量的名称以尝试了解更多图层,这里我显示前 10

names(nc$var)[1:10]

[1] "window"                  "width"                   "decimals"                "months"                  "latitudes"               "longitudes"              "15100BP-15000BP/15100BP" "15100BP-15000BP/15099BP"
[9] "15100BP-15000BP/15098BP" "15100BP-15000BP/15097BP"

因此,如果我继续寻找并转到纬度和经度名称,我会得到:

ncatt_get(nc, attributes(nc$var)$names[5])
$units
[1] "degrees north"

ncatt_get(nc, attributes(nc$var)$names[6])
$units
[1] "degrees east"

关于如何重新投影此栅格以获得 -90、90 的纬度和 -180 到 180 的经度的任何想法,你会在 +proj=longlat +ellps=WGS84 +datum=WGS84 + no_defs +towgs84=0,0,0 投影

要解决此问题,您可以设置范围:

library(raster)
r <- raster("mean_temperature-15000BP-10000BP.nc",  varname = "14000BP-13000BP/13300BP")
extent(r) <- c(-180,180,-90,90)

但请注意,有时气候数据中的经度从 0 到 360(我认为不是这里):

extent(r) <- c(0,360,-90,90)
r <- rotate(r)

要详细了解 ncdf 中的内容,您可以这样做

print(r)

当然,您只有在确定范围的情况下才想这样做,并且您可能需要联系数据提供者来报告此问题。